Насправді я знайшов відповідь на французькому форумі. Є це:
Підключіться до магазину через iTunes для Mac (я думаю, що він працює так само і на Windows, але я не тестував).
Виберіть "Книги" вгору "пов'язка на голову" (не знаю англійського слова, будь ласка, виправте :))
Клацніть при покупці в правій колонці
При наведенні курсору на книгу, яку потрібно видалити, з'явиться X. Натисніть на нього, і ваша книга буде прихована. Можна буде завантажити його ще раз (я думаю, безкоштовно, але я знову не намагався), але він більше не з’явиться на вашому пристрої.
Et voilà! У мене більше немає книги в моїй бібліотеці iBook!