Вступні книги з природничих наук, що стоять за біоінформатикою


11

Моє запитання стосується тих, хто переймається алгоритмікою обчислювальної біології. Я восени пройду курс з біоінформатики; Однак проблема полягає в тому, що я маю занадто мало досвіду в біології та хімії, щоб відчувати себе підготовленим до цього циклу лекцій (я був досить слабким до цих предметів у школі).

Чи можете ви порекомендувати якісь книги, які б добре знайомилися з питаннями природничих наук, на яких зосереджена біоінформатика?


1
Іншими словами, ви шукаєте книги з біології? Якщо так, питання повинно бути на biology.SE . Голосування закрити як офтопік.
Рафаель

З мого досвіду в галузі біоінформатики вам не знадобиться багато біології - якщо курси ведуть інформатики. Ви повинні запитати професора, хто читатиме лекції, скільки попередніх знань передбачається.
Рафаель

Це цілком справедливе питання для CS.
Гігілі

1
Це був наш довідник з біоінформатичного курсу, це те, що ви шукаєте? Не могли б ви розповісти більше про зміст курсу?
Гігілі

1
@Gigili - справді ?! Книга про нейронні мережі на перший погляд, здається, не має нічого спільного з щоденною біоінформатикою. Обчислювальна біологія / біоінформатика зазвичай не бере біологічних ідей і не застосовує їх у комп'ютерних науках, це найчастіше застосування інформатики для вирішення біологічних проблем.
iandotkelly

Відповіді:


7

Як було сказано у попередній відповіді, не є абсолютною вимогою вивчати біологію для того, щоб робити біоінформатику. Однак, якщо ви хочете ознайомитись із основоположними поняттями, такими як гени, РНК, ДНК тощо, то хороша вступна книга з біології повинна забезпечити все необхідне.

Молекулярна біологія - це не та тема, до якої можна просто зануритися в середину. Тому для того, щоб це зрозуміти, потрібно зробити кілька вступних читань. Найкраща книга - це та, яка має достатньо деталей, не припускаючи, що ви хочете стати біологом.

Пропоную поглянути на Collins Outline of College Biology. Читання розділів 2-5 та 12-15, повинно дати вам бажану інформацію. Інший вибір - «Біологія», Третє видання, Шаума, розділи 2-4 та 7-10. Обидві книги коштують менше 20,00 доларів і їх легко зрозуміти. Сподіваюсь, це допомагає.


3

Як хтось із походження інформатики та керував командою, що розробляє продукт, що включає біоінформатику, я можу співчути проблемі підбору домену - але це захоплююча область, в якій потрібно працювати.

Як вказував @JCEHR, це не є абсолютною вимогою вивчати біологію, але корисно почати підбирати деяких принципів. Біоінформатика - це не лише молекулярна біологія, геномне секвенування, експресія білка та структура білка (не хвилюйтесь, якщо ви зараз не розумієте цих термінів), але я досить впевнений, що це сфера, яку переважна більшість "традиційної біоінформатики" застосовується і буде основою будь-якого курсу з цього питання. Однією з найважливіших вимірюваних особливостей ДНК, РНК та Білка є те, що вони являють собою низку молекул, яку можна представити програмним рядком - ключові прийоми анотування, зберігання та (нечіткого) пошуку цих рядків.

Як і загальний буквар з біології, ви також можете розглянути книгу, яка обговорює геноміку. Далі виглядає добре, але це дуже дорого:

Буквар науки про геном , Грег Гібсон та Спенсер В. Муза


2

Як комп'ютерний науковець, який зробив свою другорядну роль в галузі біохімії, моя рекомендація - це путівник з мультфільму Ларрі Гоніка про генетику .

Це не жарт. Я знаю кількох поважних біоінформатиків, які таким чином засвоїли генетику. Книга пояснює більшу частину того, що якщо не все, то вам потрібно буде знати і поставити найінтуїтивніші візуальні зображення, щоб обернути свій розум навколо основних понять. І це веселе читання.


1

Як вам казали інші: це трохи залежить від книги, якою ви будете користуватися, а також від тем, які викладаєте. Іноді це буде досить самостійно. Однак для того, щоб краще підготуватися (і звикнути до термінології), подивіться на деякі праймери в Інтернеті, як-от Preparata: Біологічний буквар для вчених-комп'ютерів .

У нас є колеги, чи сайт "біостар" є дружнім клоном? Дивіться запитання: « Кращі ресурси для вивчення молекулярної біології для вченого-комп’ютера ».

Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.