як накласти форм-файл і растр?

У мене формуляр з багатокутниками. І у мене є глобальний растровий файл. Я хочу перекласти багатокутники формифільму на растрову сітку та обчислити середнє значення растру для кожного багатокутника.

Як я можу це зробити за допомогою GDAL, записуючи результати у файл форми?

У R ви можете зробити

library(raster)
library(rgdal)
r <- raster('raster_filename')
p <- readOGR('shp_path', 'shp_file')
e <- extract(r, p, fun=mean)

e - вектор із середнім значенням растрових клітин у кожному багатокутнику.

Дотримуючись поради, яку я потрапив у список розсилки gdal-dev, я використав StarSpan :

starspan --vector V --raster R1 R2 ... --stats mystats.csv avg mode

Результати зберігаються у форматі CSV. На той момент цього мені вже було достатньо, але слід якось сформувати Shapefile із цієї інформації.

Наступний сценарій дозволяє виконувати завдання з GDAL: http://pcjericks.github.io/py-gdalogr-cookbook/raster_layers.html#calculate-zonal-statistics

# Calculates statistics (mean) on values of a raster within the zones of an polygon shapefile

import gdal, ogr, osr, numpy

def zonal_stats(input_value_raster, input_zone_polygon):

    # Open data
    raster = gdal.Open(input_value_raster)
    driver = ogr.GetDriverByName('ESRI Shapefile')
    shp = driver.Open(input_zone_polygon)
    lyr = shp.GetLayer()

    # get raster georeference info
    transform = raster.GetGeoTransform()
    xOrigin = transform[0]
    yOrigin = transform[3]
    pixelWidth = transform[1]
    pixelHeight = transform[5]

    # reproject geometry to same projection as raster
    sourceSR = lyr.GetSpatialRef()
    targetSR = osr.SpatialReference()
    targetSR.ImportFromWkt(raster.GetProjectionRef())
    coordTrans = osr.CoordinateTransformation(sourceSR,targetSR)
    feat = lyr.GetNextFeature()
    geom = feat.GetGeometryRef()
    geom.Transform(coordTrans)

    # Get extent of geometry
    ring = geom.GetGeometryRef(0)
    numpoints = ring.GetPointCount()
    pointsX = []; pointsY = []
    for p in range(numpoints):
            lon, lat, z = ring.GetPoint(p)
            pointsX.append(lon)
            pointsY.append(lat)
    xmin = min(pointsX)
    xmax = max(pointsX)
    ymin = min(pointsY)
    ymax = max(pointsY)

    # Specify offset and rows and columns to read
    xoff = int((xmin - xOrigin)/pixelWidth)
    yoff = int((yOrigin - ymax)/pixelWidth)
    xcount = int((xmax - xmin)/pixelWidth)+1
    ycount = int((ymax - ymin)/pixelWidth)+1

    # create memory target raster
    target_ds = gdal.GetDriverByName('MEM').Create('', xcount, ycount, gdal.GDT_Byte)
    target_ds.SetGeoTransform((
        xmin, pixelWidth, 0,
        ymax, 0, pixelHeight,
    ))

    # create for target raster the same projection as for the value raster
    raster_srs = osr.SpatialReference()
    raster_srs.ImportFromWkt(raster.GetProjectionRef())
    target_ds.SetProjection(raster_srs.ExportToWkt())

    # rasterize zone polygon to raster
    gdal.RasterizeLayer(target_ds, [1], lyr, burn_values=[1])

    # read raster as arrays
    banddataraster = raster.GetRasterBand(1)
    dataraster = banddataraster.ReadAsArray(xoff, yoff, xcount, ycount).astype(numpy.float)

    bandmask = target_ds.GetRasterBand(1)
    datamask = bandmask.ReadAsArray(0, 0, xcount, ycount).astype(numpy.float)

    # mask zone of raster
    zoneraster = numpy.ma.masked_array(dataraster,  numpy.logical_not(datamask))

    # calculate mean of zonal raster
    return numpy.mean(zoneraster)

Завантажте своє форма форми та растр у PostGIS 2.0 та виконайте такі дії:

SELECT (ST_SummaryStats(ST_Clip(rast, geom))).*
FROM rastertable, geomtable

Я не думаю, що GDAL є найкращим інструментом для цього, але ви можете використовувати gdal_rasterize, щоб "очистити" всі значення поза полігоном.

Щось на зразок:

gdal_translate -a_nodata 0 original.tif work.tif
gdal_rasterize -burn 0 -b 1 -i work.tif yourpolygon.shp -l yourpolygon
gdalinfo -stats work.tif
rm work.tif

Програма gdal_rasterize модифікує файл, тому ми робимо копію для роботи. Ми також відзначаємо певне значення (нуль у даному випадку) як нодату. "-Burn 0 -b 1" означає записувати значення нуля в смугу 1 цільового файлу (work.tif). "-I" означає інвертну растерізацію, тому ми записуємо значення поза полігоном, а не всередині нього. Команда gdalinfo із -stats звітує про статистику діапазону. Я вважаю, що це виключить значення nodata (яке ми позначали раніше з -a_nodata).

Перетворіть файл форми в растр за допомогою gdal_rasterize та використовуйте код у http://www.spatial-ecology.net/dokuwiki/doku.php?id=wiki:geo_tools для обчислення зональної статистики для кожного багатокутника. Ви можете запустити http://km.fao.org/OFwiki/index.php/Oft-reclass, якщо ви хочете отримати тиф зі статистикою растру. Насолоджуйтесь кодом Ciao Giuseppe

Це неможливо за допомогою GDAL. Однак ви можете використовувати інші безкоштовні інструменти, наприклад, saga gis:

saga_cmd shapes_grid "Grid Values to Shapes" -GRIDS=grid.sgrd -POLYGONS=in.shp -SHAPES=out.shp-NODATA -TYPE=1

Ви також можете використовувати rasterstats thas - це модуль Python, призначений для цієї мети:

from rasterstats import zonal_stats
listofzones = zonal_stats("polygons.shp", "elevation.tif",
            stats="mean")

Потім ви можете отримати доступ до атрибуту першої зони за допомогою:

mean_of_zone1 = listofzones[0]['mean']

Ви можете використовувати інструмент обчислення точкової статистики в дугових системах, і цей інструмент можна завантажити з http://ianbroad.com/arcgis-toolbox-calculate-point-statistics-polygon-arcpy/