R gstat krige () - матриця коваріації однини в розташуванні [5.88,47.4,0]: пропуск


10

Коли я хочу виконати крігінг, він працює лише іноді, залежно від того, які значення я використовую у своїй таблиці даних. В результаті функції krige я отримую var1.pred: NA NA NA ...і var1.var: NA NA NA ...(але лише тоді, коли в своїй таблиці даних я використовую "неправильні" значення.)

Наприклад:

  • він працює завжди (поки що), коли я використовую лише 10 значень
  • він працює, коли я використовую 50 значень, але тільки з певними
  • вона працює не тоді, коли я використовую 50 значень та "неправильні" значення
  • він працює, коли я використовую 25 значень і раніше згадані "неправильні" значення

Я не розумію, чому це іноді працює, а іноді ні. Дивна річ у тому, що коли я додаю Zwiesel;49.02999878;13.22999954;2.2до даних, він працює, коли я використовую менше ~ 20 значень, але він не працює, коли я використовую більше 50 значень ...

Де моя помилка?

myWeatherTable.csv:

Place;Latitude;Longitude;Temperature
Aachen;50.77999878;6.09999990;3
Abbikenhausen;53.52999878;8.00000000;7.9
Adelbach;49.04000092;9.76000023;3.1
Adendorf;51.61999893;11.69999981;1.9
Alberzell;48.45999908;11.34000015;4.6
...
...

Мій код для виконання крипової інтерполяції

WeatherData <- read.csv(file="myWeatherTable", header = TRUE, sep ";")

coordinates(WeatherData) = ~Longitude + Latitude

vario <-  variogram(log(Temperature) ~1, WeatherData)
vario.fit <- fit.variogram(vario, vgm("Sph"))

min_lon <- min(WeatherData$Longitude)
max_lon <- max(WeatherData$Longitude)
min_lat <- min(WeatherData$Latitude)
max_lat <- max(WeatherData$Latitude)
Longitude.range <- as.numeric(c(min_lon,max_lon))
Latitude.range <- as.numeric(c(min_lat,max_lat))
grd <- expand.grid(Longitude = seq(from = Longitude.range[1], to = Longitude.range[2], by = 0.1),
  Latitude = seq(from = Latitude.range[1],to = Latitude.range[2], by = 0.1))
coordinates(grd) <- ~Longitude + Latitude
gridded(grd) <- TRUE

plot1 <- WU_data_spatial %>% as.data.frame %>%
  ggplot(aes(Longitude, Latitude)) + geom_point(size=1) + coord_equal() + 
  ggtitle("Points with measurements")

plot2 <- grd %>% as.data.frame %>%
  ggplot(aes(Longitude, Latitude)) + geom_point(size=1) + coord_equal() + 
  ggtitle("Points at which to estimate")

grid.arrange(plot1, plot2, ncol = 2)

kriged <- krige(Temperature~ 1, WeatherData, grd, model=variogram_fit)

Попередження :

1: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [5.88,47.4,0]: skipping...
2: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [5.98,47.4,0]: skipping...
3: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [6.08,47.4,0]: skipping...
4: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [6.18,47.4,0]: skipping...
...
...

Відповіді:


16

Ця помилка зазвичай повертається, оскільки у вас є дублікати місць. Ви можете перевірити це за допомогою sp::zerodistфункції.

Щоб видалити повторювані місця, які ви телефонуєте, sp::zerodistв індексі дужки.

WeatherData <- WeatherData[-zerodist(WeatherData)[,1],] 
Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.