Хороплет в R: користувацькі перерви та побудови графіків

У мене є питання щодо побудови карти хороплету. Що рекомендується щодо побудови карти із спеціальними перервами? І зробити це виглядати трохи привабливо.

У своєму сценарії я використав команду plot та spplot для візуалізації деяких даних, але я не зовсім задоволений результатом. Неважко зрозуміти, чому. Використовуючи spplot, я отримую кольорову рампу, яка повторює кольори для різних значень, що трохи дивно. Використовуючи сюжет із користувацькими перервами, я не зміг зробити кращі інтервали для значень, такі, наприклад, що на нульовому значенні на карті є білі значення. Перекошені пропорції між легендою та картою - я думаю, ймовірно, результат Rstudio.

Тож я поцікавився, чи є хтось кращі пропозиції щодо побудови карт хороплета в R за допомогою спеціальних перерв?

РЕДАКЦІЯ 20-02-2013

Як було запропоновано, я використовував ggplot2 для створення карти хороплета. Я використав код нижче. У мене виникли дві проблеми. Одне полягає в тому, що після фортифікації даних не всі дані з файлу форми переносяться в кадр даних. Тому я повинен перейменувати змінну "id" таким чином, щоб я міг об'єднати дані. Незначне питання.

Більш важливим питанням є те, що незважаючи на те, що дані в рамці даних є правильними, ggplot показує карту, де дані невірні. Значення кольору згідно легенди не відповідає значенню змінної в даних. Я щось тут не помічаю?

# Plotting polygon shapefiles (try-out)
# Load the packages
require(rgdal)
require(maptools)
require(ggplot2)
gpclibPermit() # required for the fortify method
# Load the shapefile
africa=readOGR("/home/GIS",layer="africaII")
names(africa) 
# Load the data on conflict
conflict<-read.csv("africa_conflict.csv", header=TRUE)
names(conflict)
# Merge the data together
africadat<-merge(africa, conflict, by="ISO3")
# Changing the data in the shapefile
africa@data <- africadat
# Fortify so that ggplot can plot
africa.points = fortify(africa,region="ISO3")
# Change "id" to "ISO3"such that the datasets can be merged again
names(africa.points)[names(africa.points)=="id"]<-"ISO3"
africa.df=merge(africa.points,africadat,by="ISO3")
# Plot the data
ggplot(africa.df) + 
aes(long,lat,group=group) + 
geom_polygon(aes(fill =onset))+
geom_path(color="white") +
coord_equal()

Посилання на дані реплікації

Оновлення 13-11-2015: Виправлена ​​посилання на файл форми . Дивіться відповідь нижче, щоб вирішити, як побудувати хороплет.

Я не бачу проблем з наведеним вище кодом, за винятком того, що у вас є 6 чітких рівнів onset, тому я ставлюся до них як до факторів, а не до суцільної змінної. Зверніть увагу на factorвиклик у наведеному нижче коді.

ggplot(africa.df) +
  aes(long,lat,group=group) +
  geom_polygon(aes(fill = factor(onset)))+
  geom_path(color="white") +
  coord_equal()

Цей код дає такий результат:

Якщо ви хочете користувальницькі кольори, ви можете спробувати це:

library(RColorBrewer)
my.cols <- brewer.pal(6, "Blues")

ggplot(africa.df) +
  aes(long,lat,group=group) +
  geom_polygon(aes(fill = factor(onset)))+
  scale_fill_manual("Onset\n", values = my.cols, guide = "legend") +
  geom_path(color="white") +
  coord_equal()

Що виробляє це:

Пакет classInt має ряд функцій для обчислення інтервалів для числових даних - встановіть його та прочитайте документи.

Для архівів я використовував рішення:

#### Choropleth in R example ####

## Libraries
library(classInt)    
library(lattice)
library(RColorBrewer)    
library(sp)

## Shapefile for Sub-Sahara Africa (see link in Q)
africa<-readShapeSpatial("shp/africa.shp") 

## Add data to shapefile
# In this case the number of conflict onsets between 1981-2010
africa$onset<-c(3,0,3,1,3,1,4,2,3,0,
                2,0,3,1,1,0,2,1,1,1,
                2,0,3,0,1,0,0,4,2,1,
                3,0,1,0,6,1,3,1,1,0,
                0,1,1,0,0,0,0)

## Plot 
par(mar=c(1,4,1,1),family="serif")
trellis.par.set(axis.line=list(col=NA)) # Remove borders
spplot(africa,zcol="onset",col.regions=colorRampPalette(c("white","grey10"))(20),
main=list(label="Number of civil conflict onsets 1981-2010",cex=3),
pretty=T,par.settings=list(axis.text=list(cex=3)))