Вкажіть спеціальний формат дати для аргументу colClasses у read.table / read.csv


101

Питання:

Чи є спосіб визначити формат дати при використанні аргументу colClasses у read.table / read.csv?

(Я розумію, що я можу конвертувати після імпорту, але з такою кількістю стовпців дат, як це, було б простіше зробити це на етапі імпорту)


Приклад:

У мене є .csv із стовпцями дати у форматі %d/%m/%Y.

dataImport <- read.csv("data.csv", colClasses = c("factor","factor","Date"))

Це отримує конверсію неправильно. Наприклад, 15/07/2008стає 0015-07-20.


Код, що відтворюється:

data <- 
structure(list(func_loc = structure(c(1L, 2L, 3L, 3L, 3L, 3L, 
3L, 4L, 4L, 5L), .Label = c("3076WAG0003", "3076WAG0004", "3076WAG0007", 
"3076WAG0009", "3076WAG0010"), class = "factor"), order_type = structure(c(3L, 
3L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 3L, 1L), .Label = c("PM01", "PM02", 
"PM03"), class = "factor"), actual_finish = structure(c(4L, 6L, 
1L, 2L, 3L, 7L, 1L, 8L, 1L, 5L), .Label = c("", "11/03/2008", 
"14/08/2008", "15/07/2008", "17/03/2008", "19/01/2009", "22/09/2008", 
"6/09/2007"), class = "factor")), .Names = c("func_loc", "order_type", 
"actual_finish"), row.names = c(NA, 10L), class = "data.frame")


write.csv(data,"data.csv", row.names = F)                                                        

dataImport <- read.csv("data.csv")
str(dataImport)
dataImport

dataImport <- read.csv("data.csv", colClasses = c("factor","factor","Date"))
str(dataImport)
dataImport

А ось як виглядає вихід:

вихід коду


Хакейним способом зробити це було б створити власну версію read.tableта додати formatаргумент, який передається as.Date. Я не був би здивований, якщо є кращий спосіб, про який я не думаю.
— joran

Відповіді:


158

Ви можете записати власну функцію, яка приймає рядок і перетворює її на Дату, використовуючи потрібний формат, а потім використовувати setAsдля встановлення її як asметоду. Тоді ви можете використовувати свою функцію як частину colClasses.

Спробуйте:

setAs("character","myDate", function(from) as.Date(from, format="%d/%m/%Y") )

tmp <- c("1, 15/08/2008", "2, 23/05/2010")
con <- textConnection(tmp)

tmp2 <- read.csv(con, colClasses=c('numeric','myDate'), header=FALSE)
str(tmp2)

Потім змініть, якщо потрібно, для роботи над вашими даними.

Редагувати ---

Ви можете запустити setClass('myDate')перший, щоб уникнути попередження (ви можете проігнорувати попередження, але воно може набриднути, якщо ви це зробите багато, і це простий дзвінок, який позбавляється від нього).


2
Нічого собі - setAs - рятівник! Як я ніколи раніше не бачив цієї функції?
— користувач295691

4
Зауважте, що ви можете отримати попередження "без визначення для класу" myDate "', як це детально описано в цьому запитанні .
— Danny D'Amours

1
Що setMethod('myDate')робити? Запуск цього просто дає мені помилку ...
— Josh O'Brien

1
@ JoshO'Brien, вибачте, що це мало бути setClassвиправлено зараз. Що це робить, це запобігти setAsнадсилати попередження про те, що "myDate" не існує як клас. Попередження нешкідливо, і все ще працює, але встановлення класу означає, що ви навіть не бачите попередження.
— Грег Сног

1
@MySchizoBuddy, Якщо у вас є лише один стовпець дати, і ви робите це одноразово, то, мабуть, не має значення, яким саме способом це зробити. Але якщо у вашому наборі даних є кілька стовпців, які є датами, я думаю, такий підхід, ймовірно, буде простішим, ніж зміна кожної колонки після читання.
— Грег Сніг

25

Якщо ви бажаєте змінити лише один формат дати, ви можете використовувати Defaultsпакет, щоб змінити формат за замовчуванням в межахas.Date.character

library(Defaults)
setDefaults('as.Date.character', format = '%d/%M/%Y')
dataImport <- read.csv("data.csv", colClasses = c("factor","factor","Date"))
str(dataImport)
## 'data.frame':    10 obs. of  3 variables:
##  $ func_loc     : Factor w/ 5 levels "3076WAG0003",..: 1 2 3 3 3 3 3 4 4 5
##  $ order_type   : Factor w/ 3 levels "PM01","PM02",..: 3 3 1 1 1 1 2 2 3 1
##  $ actual_finish: Date, format: "2008-10-15" "2009-10-19" NA "2008-10-11" ...

Я думаю, що відповідь @Greg Snow набагато краща, оскільки це не змінює поведінку часто використовуваної функції за замовчуванням.


7

Якщо вам також потрібен час:

setClass('yyyymmdd-hhmmss')
setAs("character","yyyymmdd-hhmmss", function(from) as.POSIXct(from, format="%Y%m%d-%H%M%S"))
d <- read.table(colClasses="yyyymmdd-hhmmss", text="20150711-130153")
str(d)
## 'data.frame':    1 obs. of  1 variable:
## $ V1: POSIXct, format: "2015-07-11 13:01:53"

2

Давно, тим часом, проблему вирішив Едлі Вікхем. Тож сьогодні рішення зводиться до онлінера:

library(readr)
data <- read_csv("data.csv", 
                  col_types = cols(actual_finish = col_datetime(format = "%d/%m/%Y")))

Можливо, ми хочемо навіть позбутися зайвих речей:

data <- as.data.frame(data)
Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.