Знайти цілочисельний індекс рядків з NaN у фреймі даних pandas


94

У мене є панда DataFrame, така:

                    a         b
2011-01-01 00:00:00 1.883381  -0.416629
2011-01-01 01:00:00 0.149948  -1.782170
2011-01-01 02:00:00 -0.407604 0.314168
2011-01-01 03:00:00 1.452354  NaN
2011-01-01 04:00:00 -1.224869 -0.947457
2011-01-01 05:00:00 0.498326  0.070416
2011-01-01 06:00:00 0.401665  NaN
2011-01-01 07:00:00 -0.019766 0.533641
2011-01-01 08:00:00 -1.101303 -1.408561
2011-01-01 09:00:00 1.671795  -0.764629

Чи існує ефективний спосіб знайти "цілочисельний" індекс рядків з NaN? У цьому випадку бажаний результат повинен бути [3, 6].


12
Якщо ви просто хочете виділити рядки за допомогою nan, ви можете це зробитиdf[np.isnan(df['b'])]
lazy1

4
Слідом за @ lazy1 - замість того, щоб використовувати numpys, isnanви також можете використовуватиdf['b'].isnull()
jmetz

Відповіді:


46

Для DataFrame df:

import numpy as np
index = df['b'].index[df['b'].apply(np.isnan)]

поверне вам те, MultiIndexщо ви можете використовувати для індексації df, наприклад:

df['a'].ix[index[0]]
>>> 1.452354

Для цілочисельного індексу:

df_index = df.index.values.tolist()
[df_index.index(i) for i in index]
>>> [3, 6]

1
Як би інтуїтивно це не ixзвучало, з якихось причин здається, що це було припинено на користьiloc
кардамон

144

Ось більш просте рішення:

inds = pd.isnull(df).any(1).nonzero()[0]

In [9]: df
Out[9]: 
          0         1
0  0.450319  0.062595
1 -0.673058  0.156073
2 -0.871179 -0.118575
3  0.594188       NaN
4 -1.017903 -0.484744
5  0.860375  0.239265
6 -0.640070       NaN
7 -0.535802  1.632932
8  0.876523 -0.153634
9 -0.686914  0.131185

In [10]: pd.isnull(df).any(1).nonzero()[0]
Out[10]: array([3, 6])

29
У підсумку я використав це:np.where(df['b'].notnull())[0]

дякую, .nonzero()[0]краще ніж [i for i, k in enumerate(mask) if k].)
Вінанд

2
Можливо, ви могли б ще спростити це:r, _ = np.where(df.isna())
cs95

2
додати, .to_numpy()щоб перетворити спочатку в масив numpy -pd.isnull(df).any(1).to_numpy().nonzero()
7bStan

13

Однорядкове рішення. Однак це працює лише для однієї колонки.

df.loc[pandas.isna(df["b"]), :].index

Це те, що я шукав. Я зробив це у списку, загорнувши його list(...)приблизно таким чином:list(df.loc[pandas.isna(df["b"]), :].index)
Деніел Батлер

9

І про всяк випадок, якщо ви хочете замість цього знайти координати 'nan' для всіх стовпців (припустимо, що всі вони є числовими), ось вам:

df = pd.DataFrame([[0,1,3,4,np.nan,2],[3,5,6,np.nan,3,3]])

df
   0  1  2    3    4  5
0  0  1  3  4.0  NaN  2
1  3  5  6  NaN  3.0  3

np.where(np.asanyarray(np.isnan(df)))
(array([0, 1]), array([4, 3]))

9

Не знаю, чи це занадто пізно, але ви можете використовувати np.where, щоб знайти індекси не значень як таких:

indices = list(np.where(df['b'].isna()[0]))

4

Ось тести для кількох методів:

%timeit np.where(np.isnan(df['b']))[0]
%timeit pd.isnull(df['b']).nonzero()[0]
%timeit np.where(df['b'].isna())[0]
%timeit df.loc[pd.isna(df['b']), :].index

І відповідні терміни:

333 µs ± 9.95 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
280 µs ± 220 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
313 µs ± 128 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
6.84 ms ± 1.59 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)

Здавалося б, pd.isnull(df['DRGWeight']).nonzero()[0]день виграє з точки зору часу, але будь-який із трьох найкращих методів має порівнянні показники.


3

у випадку, якщо у вас є індекс дати та часу, і ви хочете мати значення:

df.loc[pd.isnull(df).any(1), :].index.values


1

Ось ще один простіший прийом:

df = pd.DataFrame([[0,1,3,4,np.nan,2],[3,5,6,np.nan,3,3]])

inds = np.asarray(df.isnull()).nonzero()

(array([0, 1], dtype=int64), array([4, 3], dtype=int64))

1

Я шукав усі індекси рядків зі значеннями NaN.
Моє робоче рішення:

def get_nan_indexes(data_frame):
    indexes = []
    print(data_frame)
    for column in data_frame:
        index = data_frame[column].index[data_frame[column].apply(np.isnan)]
        if len(index):
            indexes.append(index[0])
    df_index = data_frame.index.values.tolist()
    return [df_index.index(i) for i in set(indexes)]

0

Нехай фрейм даних називається df, а зацікавлений стовпець (тобто стовпець, в якому ми намагаємося знайти нульові значення ) має значення "b" . Тоді наступний фрагмент дає бажаний індекс null у фреймі даних:

   for i in range(df.shape[0]):
       if df['b'].isnull().iloc[i]:
           print(i)
Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.