помилка pydot та graphviz: Не вдалося імпортувати dot_parser, завантаження точкових файлів не буде можливим

Коли я запускаю дуже простий код з pydot

import pydot
graph = pydot.Dot(graph_type='graph')

for i in range(3):

  edge = pydot.Edge("king", "lord%d" % i)
  graph.add_edge(edge)

vassal_num = 0
for i in range(3):
  for j in range(2):
    edge = pydot.Edge("lord%d" % i, "vassal%d" % vassal_num)
    graph.add_edge(edge)
    vassal_num += 1

graph.write_png('example1_graph.png')

Він друкує мені повідомлення про помилку:

Couldn't import dot_parser, loading of dot files will not be possible.

Я використовую python 2.7.3

Відповідь за pydot >= 1.1:

Несумісність (вище за течією) pydotбула виправлена 6dff94b3f1 , і таким чином pydot >= 1.1буде сумісна зpyparsing >= 1.5.7 .

Відповідь, що стосується pydot <= 1.0.28:

Для всіх, хто стикається з цим, це пов’язано зі змінами піпарсингу від 1.x до 2.x випуску. Щоб встановити pydot за допомогою pip, спочатку встановіть старішу версію pyparsing:

pip install pyparsing==1.5.7
pip install pydot==1.0.28

Якщо ви не встановили pyparsingза допомогою pip, а замість цього використовувались setup.py, перегляньте це рішення для видалення пакета. Дякуємо @qtips.

У ppo-репо є новий пакет під назвою pydot2, який правильно працює з pyparsing2. Я не зміг знизити свої пакунки, оскільки matplotlib залежить від нового пакету pyparsing.

Примітка: python2.7 з макпортів

pydot використовував приватну змінну модуля (_noncomma) від pyparsing. Наведений нижче diff виправляє його для використання для піпарсингу 2.0.1:

diff --git a/dot_parser.py b/dot_parser.py
index dedd61a..138d152 100644
--- a/dot_parser.py
+++ b/dot_parser.py
@@ -25,8 +25,9 @@ from pyparsing import __version__ as pyparsing_version
 from pyparsing import ( nestedExpr, Literal, CaselessLiteral, Word, Upcase, OneOrMore, ZeroOrMore,
     Forward, NotAny, delimitedList, oneOf, Group, Optional, Combine, alphas, nums,
     restOfLine, cStyleComment, nums, alphanums, printables, empty, quotedString,
-    ParseException, ParseResults, CharsNotIn, _noncomma, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement )
+    ParseException, ParseResults, CharsNotIn, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement )

+_noncomma = "".join( [ c for c in printables if c != "," ] )

 class P_AttrList:

Я роздрібнив сховище pydot [1], застосував патч Gabi Davar та деякі зміни для підтримки python-3. Пакет доступний в PyPI [2].

Ура

• [1] https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32
• [2] https://pypi.python.org/pypi/pydot2

$ sudo pip uninstall pydot

$ sudo pip install pydot2

Дивіться наступне посилання: http://infidea.net/troubleshooting-couldnt-import-dot_parser-loading-of-dot-files-will-not-be-possible/

Рішенням було не встановлення pydot звідкись, а "python-pydot" з офіційних сховищ ubuntu.

Зараз існує щонайменше ще 2 версії, які, як видається, підтримують PyParsing-2 та Python-3:

• PyDotPlus від Карлоса Дженкінса з приємною програмою для побудови та вишуканою документацією . Однак вам потрібно змінити ім'я папки з site-packages\pydotplusна, site-packages\pydotщоб вона працювала з існуючими програмами, які імпортують pydot.
• pydot3k від bmcorser . На жаль, не вийшло!
• prologic / pydot від Джеймса Міллса, посилання на офіційну сторінку коду Google pydot як ...

  відділення для сумісності Python 3

• і ось робоче посилання на pydot2 Девіда Вілла, який працює чудово: https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32

У мене була проблема знову, і моє вище рішення не спрацювало. Якщо це справедливо для вас, і ви також використовуєте Anaconda на Mac з El Capitan, спробуйте це:

conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG graphviz`
conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG pydot

Що я зробив наприкінці після стількох спроб із того, що я побачив тут (псевдопослідовність, щоб він працював у networkx):

apt-get remove python-pydot
pip install pydotplus
apt-get install libcgraph6
apt-get install python-pygraphviz


# pip freeze | grep pydot
 pydotplus==2.0.2
# pip freeze | grep pyparsing
pyparsing==2.2.0
# pip freeze | grep graphviz
pygraphviz==1.2
# python -c 'import pydotplus'
#

Це працювало для мене (Mac OS X 10.9 з Python 2.7.10 на Anaconda):

conda uninstall pydot

Тоді,

conda install pydot

Піпарсінг при цьому знижується (з 2.x до 1.5.7) після встановлення підота. Майбутні Googlers: це дозволило мені правильно встановити та імпортувати Theano.

На OSX Mavericks наступний трюк ... Я отримав таку ж помилку, але внизу також була скарга на те, що виконуваний графік графік відсутній ... Я думаю, що проблема була в тому, що я встановив graphviz до інших модулів?

brew uninstall graphviz
brew install graphviz

Якщо інші рішення не працюють, це швидкий і брудний метод вирішення проблеми:

Цей приклад з python 2.7 на Ubuntu 16.04.

Відредагуйте файл python2.7 / site-пакети / keras / utils / visualize_util.py та коментуйте сегмент коду нижче.

if not pydot.find_graphviz():
    raise ImportError('Failed to import pydot. You must install pydot'
                      ' and graphviz for `pydotprint` to work.')

find_graphviz () надлишковий для новіших версій pydot, і вищезазначений виклик не працює.

Я також зіткнувся з проблемою і мій pydot == 1.0.28 під час pyparsing == 2.2.0. Я вирішив проблему, завантаживши з google найновіший pydot 1.2.3 (tar.gz), а потім встановив його в автономному режимі. Коли я оновив pydot в ubuntu 14.04, він сказав, що pydot 1.0.28 - це найновіша версія. Тому я завантажую з Google версію 1.2.3.

Вам потрібно зменшити pyparsing з версії 2.x до версії 1.5.7, щоб підот працював правильно.

Для win-64, використовуючи Conda, це працювало для мене:

conda install -c https://conda.anaconda.org/Trentonoliphant pyparsing=1.5.7

Потім я відключив / видалив 2.x версію та перезавантажив розпізнавання в моєму сценарії:

pyparsing = reload(pyparsing)
pydot = reload(pydot)

Щоб перевірити, чи працює у вас правильна версія:

print pyparsing.__version__