Розділіть великий фрейм даних панд


86

У мене великий фрейм даних із 423244 рядками. Я хочу поділити це на 4. Я спробував наступний код, який дав помилку?ValueError: array split does not result in an equal division

for item in np.split(df, 4):
    print item

Як розділити цей кадр даних на 4 групи?


Ми хочемо np.split(df, N)функцію, будь ласка.
Sören

Відповіді:


182

Використання np.array_split:

Docstring:
Split an array into multiple sub-arrays.

Please refer to the ``split`` documentation.  The only difference
between these functions is that ``array_split`` allows
`indices_or_sections` to be an integer that does *not* equally
divide the axis.

In [1]: import pandas as pd

In [2]: df = pd.DataFrame({'A' : ['foo', 'bar', 'foo', 'bar',
   ...:                           'foo', 'bar', 'foo', 'foo'],
   ...:                    'B' : ['one', 'one', 'two', 'three',
   ...:                           'two', 'two', 'one', 'three'],
   ...:                    'C' : randn(8), 'D' : randn(8)})

In [3]: print df
     A      B         C         D
0  foo    one -0.174067 -0.608579
1  bar    one -0.860386 -1.210518
2  foo    two  0.614102  1.689837
3  bar  three -0.284792 -1.071160
4  foo    two  0.843610  0.803712
5  bar    two -1.514722  0.870861
6  foo    one  0.131529 -0.968151
7  foo  three -1.002946 -0.257468

In [4]: import numpy as np
In [5]: np.array_split(df, 3)
Out[5]: 
[     A    B         C         D
0  foo  one -0.174067 -0.608579
1  bar  one -0.860386 -1.210518
2  foo  two  0.614102  1.689837,
      A      B         C         D
3  bar  three -0.284792 -1.071160
4  foo    two  0.843610  0.803712
5  bar    two -1.514722  0.870861,
      A      B         C         D
6  foo    one  0.131529 -0.968151
7  foo  three -1.002946 -0.257468]

Дуже дякую! На додаток до цього я хочу застосувати якусь функцію до кожної групи? Як отримати доступ до груп по одній?
Nilani Algiriyage

7
@NilaniAlgiriyage - array_splitповертає список DataFrames, так що ви можете просто прокрутити список ...
root

Я розділяю фрейм даних, оскільки він занадто великий. Я хочу взяти першу групу та застосувати функцію, потім другу групу та застосувати функцію тощо, так як мені отримати доступ до кожної групи?
Nilani Algiriyage

1
Як ви не отримаєте AttributeError, оскільки Dataframe не має "розміру".
Boosted_d16

2
Ця відповідь застаріла:AttributeError: 'DataFrame' object has no attribute 'size'
Tjorriemorrie

33

Я хотів зробити те саме, і у мене були спочатку проблеми з функцією розділення, потім проблеми з установкою pandas 0.15.2, тому я повернувся до своєї старої версії і написав невелику функцію, яка працює дуже добре. Сподіваюся, це може допомогти!

# input - df: a Dataframe, chunkSize: the chunk size
# output - a list of DataFrame
# purpose - splits the DataFrame into smaller chunks
def split_dataframe(df, chunk_size = 10000): 
    chunks = list()
    num_chunks = len(df) // chunk_size + 1
    for i in range(num_chunks):
        chunks.append(df[i*chunk_size:(i+1)*chunk_size])
    return chunks

5
набагато швидше, ніж використання np.array_split ()
jgaw

4
Правильний спосіб обчислення numberChunks імпортувати математичне числоChunks = math.ceil (len (df) / chunkSize)
Сергій Лейко

21

Я думаю, тепер ми можемо використовувати для цього звичайний ilocс range.

chunk_size = int(df.shape[0] / 4)
for start in range(0, df.shape[0], chunk_size):
    df_subset = df.iloc[start:start + chunk_size]
    process_data(df_subset)
    ....

1
Простий та інтуїтивно зрозумілий
rmstmppr

13

Майте на увазі, що np.array_split(df, 3)кадр даних розбивається на 3 підкадри даних, тоді як split_dataframeфункція, визначена у відповіді @ elixir , при split_dataframe(df, chunk_size=3)виклику як , розбиває кадр даних на всі chunk_sizeрядки.

Приклад:

З np.array_split:

df = pd.DataFrame([1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11], columns=['TEST'])
df_split = np.array_split(df, 3)

... ви отримуєте 3 підкадри даних:

df_split[0] # 1, 2, 3, 4
df_split[1] # 5, 6, 7, 8
df_split[2] # 9, 10, 11

З split_dataframe:

df_split2 = split_dataframe(df, chunk_size=3)

... ви отримуєте 4 підкадри даних:

df_split2[0] # 1, 2, 3
df_split2[1] # 4, 5, 6
df_split2[2] # 7, 8, 9
df_split2[3] # 10, 11

Сподіваюся, я маю рацію, і що це корисно.


чи є простий спосіб зробити цей процес випадковим. Я можу лише думати про те, щоб додати випадковий стовпець, розділити та видалити випадковий стовпець, але може бути простіший спосіб
Рутгер Хофсте

вони повинні бути однаковими за розмірами?
InquilineKea

8

Увага:

np.array_splitне працює з numpy-1.9.0. Я перевірив: це працює з 1.8.1.

Помилка:

Кадр даних не має атрибута 'size'


6
я подав помилку в pandas github: github.com/pydata/pandas/issues/8846, схоже, це вже виправлено для pandas 0.15.2
yemu

4

Ви можете використовувати groupby, припускаючи, що у вас є цілочисельний індекс:

import math
df = pd.DataFrame(dict(sample=np.arange(99)))
rows_per_subframe = math.ceil(len(df) / 4.)

subframes = [i[1] for i in df.groupby(np.arange(len(df))//rows_per_subframe)]

Примітка: groupbyповертає кортеж, в якому 2-м елементом є кадр даних, таким чином, дещо складне вилучення.

>>> len(subframes), [len(i) for i in subframes]
(4, [25, 25, 25, 24])

1

Я також зазнав, що np.array_split не працює з Pandas DataFrame. Моє рішення полягало в тому, щоб розділити лише індекс DataFrame, а потім ввести новий стовпець із міткою "група":

indexes = np.array_split(df.index,N, axis=0)
for i,index in enumerate(indexes):
   df.loc[index,'group'] = i

Це робить операції згрупування дуже зручними, наприклад, для розрахунку середнього значення кожної групи:

df.groupby(by='group').mean()

0

Ви можете використовувати розуміння списків, щоб зробити це в один рядок

n = 4
chunks = [df[i:i+n] for i in range(0,df.shape[0],n)]
Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.