Запуск ноутбука IPython / Jupyter неінтерактивно

Хто-небудь знає, чи можна запустити блокнот IPython / Jupyter неінтерактивно з командного рядка і .ipynbзберегти отриманий файл із результатами запуску. Якщо це ще не можливо, наскільки важко було б реалізувати за допомогою phantomJS, щось увімкнути та вимкнути ядро, а щось увімкнути та вимкнути веб-сервер?

Щоб бути більш конкретним, припустимо, що у мене вже є блокнот, original.ipynbі я хочу повторно виконати всі комірки цього блокнота і зберегти результати в новому блокноті new.ipynb, але зробіть це однією командою в командному рядку, не вимагаючи взаємодії в браузері або закрити ядро ​​або веб-сервер, і припустивши, що жодне ядро ​​або веб-сервер вже не запущено.

приклад команди:

$ ipython notebook run original.ipynb --output=new.ipynb

Так, це можливо, і легко, це (в основному) буде в ядрі IPython для 2.0, я б запропонував розглянути ці приклади зараз.

[редагувати]

$ jupyter nbconvert --to notebook --execute original.ipynb --output=new.ipynb

Зараз це в Jupyter NbConvert. NbConvert поставляється з купою Preprocessors, які за замовчуванням вимкнені, два з них ( ClearOutputPreprocessorі ExecutePreprocessor) представляють інтерес. Ви можете або увімкнути їх у своєму (локальному | глобальному) файлі конфігурації через c.<PreprocessorName>.enabled=True(верхній регістр, який є python), або в командному рядку, --ExecutePreprocessor.enabled=Trueзберігаючи решту команди як завжди.

--ExecutePreprocessor.enabled=TrueМають зручні --executeпсевдоніми , які можуть бути використані на останню версію NbConvert. За --inplaceбажанням його можна поєднувати з

Наприклад, перетворити на html після запуску ноутбука без голови:

$ jupyter nbconvert --to=html --execute RunMe.ipynb

перетворення в PDF після видалення вихідних даних

$ ipython nbconvert --to=pdf --ClearOutputPreprocessor.enabled=True RunMe.ipynb

Це (звичайно) працює з ядрами, не пов'язаними з python, створюючи <insert-your-language-here>ядро, якщо встановлено --profile=<your fav profile>. Перетворення може бути справді довгим, оскільки потрібно перезапустити ноутбук. Ви можете перетворити блокнот на ноутбук за допомогою цієї --to=notebookопції.

Існують різні інші варіанти (час очікування, дозволити помилки, ...), які, можливо, доведеться встановити / скасувати залежно від випадку використання. Дивіться документацію і звичайно jupyter nbconvert --help, --help-allабо nbconvert інтерактивної документації для отримання додаткової інформації.

Поки ця функціональність не стане частиною ядра, я створив невеличку програму командного рядка, яка робить саме те, що ви хочете. Це називається runipy, і ви можете встановити його за допомогою pip install runipy. Джерело і рідй знаходяться на GitHub .

Запустіть і замініть оригінальний файл .ipunb:

jupyter nbconvert --ExecutePreprocessor.timeout=-1 --to notebook --inplace --execute original.ipynb

Щоб охопити деякі функції, такі як паралельні працівники, параметри введення, надсилання електронної пошти або введення / виведення S3 ... ви можете встановити jupyter-runner

pip install jupyter-runner

Readme на github: https://github.com/omar-masmoudi/jupyter-runner

Ви можете просто запустити сервер iPython-Notebook через командний рядок:

ipython notebook --pylab inline

Це дозволить запустити сервер у неінтерактивному режимі, і всі результати будуть надруковані під кодом. Потім ви можете зберегти файл .ipynb, який включає код і вихід.