GraphViz - Як підключити підграф?

У DOTмові для GraphViz, я намагаюся уявити діаграму залежності. Мені потрібно мати можливість мати вузли всередині контейнера та вміти робити вузли та / або контейнери залежними від інших вузлів та / або контейнерів.

Я використовую subgraphдля представлення своїх контейнерів. Зв'язування вузлів працює чудово, але я не можу зрозуміти, як підключити підграф.

З огляду на нижченаведену програму, мені потрібно вміти підключатися cluster_1і cluster_2зі стрілкою, але все, що я намагався, створює нові вузли замість підключення кластерів:

digraph G {

    graph [fontsize=10 fontname="Verdana"];
    node [shape=record fontsize=10 fontname="Verdana"];

    subgraph cluster_0 {
        node [style=filled];
        "Item 1" "Item 2";
        label = "Container A";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_1 {
        node [style=filled];
        "Item 3" "Item 4";
        label = "Container B";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_2 {
        node [style=filled];
        "Item 5" "Item 6";
        label = "Container C";
        color=blue;
    }

    // Renders fine
    "Item 1" -> "Item 2";
    "Item 2" -> "Item 3";

    // Both of these create new nodes
    cluster_1 -> cluster_2;
    "Container A" -> "Container C";
}

Посібник користувача DOT дає наступний приклад графіку з кластерами з краями між кластерами:

ВАЖЛИВО: Початкове compound=trueповідомлення обов'язкове.

digraph G {
  compound=true;
  subgraph cluster0 {
    a -> b;
    a -> c;
    b -> d;
    c -> d;
  }
  subgraph cluster1 {
    e -> g;
    e -> f;
  }
  b -> f [lhead=cluster1];
  d -> e;
  c -> g [ltail=cluster0,lhead=cluster1];
  c -> e [ltail=cluster0];
  d -> h;
}

... і краї між вузлами та кластерами:

Для зручності посилання рішення, описане у відповіді HighPerformanceMark, застосованому безпосередньо до оригінального питання, виглядає приблизно так:

digraph G {

    graph [fontsize=10 fontname="Verdana" compound=true];
    node [shape=record fontsize=10 fontname="Verdana"];

    subgraph cluster_0 {
        node [style=filled];
        "Item 1" "Item 2";
        label = "Container A";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_1 {
        node [style=filled];
        "Item 3" "Item 4";
        label = "Container B";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_2 {
        node [style=filled];
        "Item 5" "Item 6";
        label = "Container C";
        color=blue;
    }

    // Edges between nodes render fine
    "Item 1" -> "Item 2";
    "Item 2" -> "Item 3";

    // Edges that directly connect one cluster to another
    "Item 1" -> "Item 3" [ltail=cluster_0 lhead=cluster_1];
    "Item 1" -> "Item 5" [ltail=cluster_0 lhead=cluster_2];
}

compound=trueУ graphдекларації має життєво важливе значення. Це дає результат:

Зауважте, що я змінив ребра на опорні вузли в кластері, додав атрибути ltail і lhead до кожного краю, вказавши ім'я кластера, і додав атрибут рівня графа 'складова = істина'.

Що стосується занепокоєння, що, можливо, захочеться з'єднати кластер без вузлів всередині нього, моє рішення було завжди додавати вузол до кожного кластеру, наданий у стилі style = plaintext. Використовуйте цей вузол для позначення кластера (замість вбудованого атрибута "label" кластера, який слід встановити на порожню рядок (в Python, label='""'). Це означає, що я більше не додаю ребра, які безпосередньо з'єднують кластери, але це працює в моїй конкретній ситуації.

Переконайтеся, що ви використовуєте fdpмакет для файлу. Я не думаю, що neatoпідтримує кластери.