У мене є великий фрейм даних (порядку декількох ГБ), який я хотів би перетворити на data.table
. Використання as.data.table
створює копію кадру даних, а це означає, що мені потрібна доступна пам’ять принаймні вдвічі більша за розмір даних. Чи є спосіб зробити перетворення без копії?
Ось простий приклад для демонстрації:
library(data.table)
N <- 1e6
K <- 1e2
data <- as.data.frame(rep(data.frame(rnorm(N)), K))
gc(reset=TRUE)
tracemem(data)
data <- as.data.table(data)
gc()
З виходом:
library(data.table)
# data.table 1.8.10 For help type: help("data.table")
N <- 1e6
K <- 1e2
data <- as.data.frame(rep(data.frame(rnorm(N)), K))
gc(reset=TRUE)
# used (Mb) gc trigger (Mb) max used (Mb)
# Ncells 303759 16.3 597831 32.0 303759 16.3
# Vcells 100442572 766.4 402928632 3074.2 100442572 766.4
tracemem(data)
# [1] "<0x363fda0>"
data <- as.data.table(data)
# tracemem[0x363fda0 -> 0x31e4260]: copy as.data.table.data.frame as.data.table
gc()
# used (Mb) gc trigger (Mb) max used (Mb)
# Ncells 304519 16.3 597831 32.0 306162 16.4
# Vcells 100444242 766.4 322342905 2459.3 200933219 1533.0