Витягніть колонку dplyr tbl як вектор

Чи є більш стислий спосіб отримати один стовпчик dplyr tbl як вектор, з tbl з бек-ендом бази даних (тобто кадр / таблицю даних не можна безпосередньо підмножити)?

require(dplyr)
db <- src_sqlite(tempfile(), create = TRUE)
iris2 <- copy_to(db, iris)
iris2$Species
# NULL

Це було б занадто просто, так

collect(select(iris2, Species))[, 1]
# [1] "setosa"     "setosa"     "setosa"     "setosa"  etc.

Але це здається трохи незграбним.

З dplyr 0.7.0 ви можете використовувати pullдля отримання вектора від a tbl.

library("dplyr")
#> 
#> Attaching package: 'dplyr'
#> The following objects are masked from 'package:stats':
#> 
#>     filter, lag
#> The following objects are masked from 'package:base':
#> 
#>     intersect, setdiff, setequal, union
db <- src_sqlite(tempfile(), create = TRUE)
iris2 <- copy_to(db, iris)
vec <- pull(iris2, Species)
head(vec)
#> [1] "setosa" "setosa" "setosa" "setosa" "setosa" "setosa"

Відповідно до коментаря @nacnudus, схоже, що pullфункція була реалізована в dplyr 0.6:

iris2 %>% pull(Species)

Для старих версій dplyr ось акуратна функція, щоб зробити витягування стовпця трохи приємніше (простіше вводити та легше читати):

pull <- function(x,y) {x[,if(is.name(substitute(y))) deparse(substitute(y)) else y, drop = FALSE][[1]]}

Це дозволяє вам виконувати будь-що з цього:

iris2 %>% pull('Species')
iris2 %>% pull(Species)
iris2 %>% pull(5)

У результаті ...

 [1] 21.0 21.0 22.8 21.4 18.7 18.1 14.3 24.4 22.8 19.2 17.8 16.4 17.3 15.2 10.4 10.4 14.7 32.4 30.4 33.9 21.5 15.5 15.2 13.3 19.2 27.3 26.0 30.4 15.8 19.7 15.0 21.4

І він також чудово працює з фреймами даних:

> mtcars %>% pull(5)
 [1] 3.90 3.90 3.85 3.08 3.15 2.76 3.21 3.69 3.92 3.92 3.92 3.07 3.07 3.07 2.93 3.00 3.23 4.08 4.93 4.22 3.70 2.76 3.15 3.73 3.08 4.08 4.43
[28] 3.77 4.22 3.62 3.54 4.11

Хороший спосіб зробити це в v0.2 з dplyr:

iris2 %>% select(Species) %>% collect %>% .[[5]]

Або якщо ви віддаєте перевагу:

iris2 %>% select(Species) %>% collect %>% .[["Species"]]

Або якщо ваш стіл не надто великий, просто ...

iris2 %>% collect %>% .[["Species"]]

Ви також можете використовувати те, unlistщо мені здається легше прочитати, оскільки вам не потрібно повторювати назву стовпця або вказувати індекс.

iris2 %>% select(Species) %>% unlist(use.names = FALSE)

Я б скористався extract2функцією зручності від magrittr:

library(magrittr)
library(dplyr)

iris2 %>%
  select(Species) %>%
  extract2(1)  

Я, мабуть, напишу:

collect(select(iris2, Species))[[1]]

Оскільки dplyr призначений для роботи з tbls даних, немає кращого способу отримати єдиний стовпець даних.

@ Luke1018 запропонував це рішення в одному з коментарів:

Ви також можете використовувати magrittrоператор експозиції ( %$%), щоб витягнути вектор з кадру даних.

Наприклад:

iris2 %>% select(Species) %>% collect() %$% Species

Я вважав, що заслужив власну відповідь.

Якщо ви звикли використовувати квадратні дужки для індексації, іншим варіантом є просто зафіксувати звичайний підхід індексації у виклику до deframe () , наприклад:

library(tidyverse)

iris2 <- as_tibble(iris)

# using column name
deframe(iris2[, 'Sepal.Length'])

# [1] 5.1 4.9 4.7 4.6 5.0 5.4

# using column number
deframe(iris2[, 1])

# [1] 5.1 4.9 4.7 4.6 5.0 5.4

Це і pull () - це досить непогані способи отримання стовпчика "tabble".