Порядок упорядкування рядків у geom_bar ggplot2


119

Я намагаюся зробити смугу, де ділянка впорядкована від miRNAнайвищої valueдо miRNAнайнижчої. Чому мій код не працює?

> head(corr.m)

        miRNA         variable value
1    mmu-miR-532-3p      pos     7
2    mmu-miR-1983        pos    75
3    mmu-miR-301a-3p     pos    70
4    mmu-miR-96-5p       pos     5
5    mmu-miR-139-5p      pos    10
6    mmu-miR-5097        pos    47

ggplot(corr.m, aes(x=reorder(miRNA, value), y=value, fill=variable)) + 
  geom_bar(stat="identity")

Відповіді:


216

Ваш код працює добре, за винятком того, що барплот замовляється від низького до високого. Коли ви хочете замовити планки від високих до низьких, вам доведеться додати -знак раніше value:

ggplot(corr.m, aes(x = reorder(miRNA, -value), y = value, fill = variable)) + 
  geom_bar(stat = "identity")

що дає:

введіть тут опис зображення


Використовувані дані:

corr.m <- structure(list(miRNA = structure(c(5L, 2L, 3L, 6L, 1L, 4L), .Label = c("mmu-miR-139-5p", "mmu-miR-1983", "mmu-miR-301a-3p", "mmu-miR-5097", "mmu-miR-532-3p", "mmu-miR-96-5p"), class = "factor"),
                         variable = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = "pos", class = "factor"),
                         value = c(7L, 75L, 70L, 5L, 10L, 47L)),
                    class = "data.frame", row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6"))

він чомусь не замовляється в моєму сюжеті
user3741035

@ user3741035 Дивно. Ви використовували його на наборі даних, наведених вище, або на цілому наборі даних?
Jaap

Яку версію R & ggplot ви використовуєте? Чи можете ви також ввести більший зразок набору даних (бажано, щоб було більше одного значення variable)?
Jaap

6
знайшов рішення: я завантажив бібліотеку (gplots), яка переплутала речі
user3741035

1
@maycca Це дає мені правильний результат (для обох OSX 10.10.4 / Windows 7, R 3.2.3 та ggplot2 2.1.0). Можливо, слід почати з нового сеансу?
Яап
Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.