"RuntimeError: переконайтеся, що виконувані файли Graphviz знаходяться на шляху вашої системи" після встановлення Graphviz 2.38

Я завантажив Graphviz 2.38версію MSI і встановив під папкою C:\Python34, потім запустив pip install Graphviz, все пройшло добре. Я додав шлях до системи C:\Python34\bin. Коли я спробував запустити тестовий сценарій, в черзі filename=dot.render(filename='test'), я отримав повідомлення

 RuntimeError: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'test'], make sure the Graphviz executables are on your systems' path

Я намагався поставити "C:\Python34\bin\dot.exe"шлях до системи, але це не спрацювало, і я навіть створив нову змінну середовища "GRAPHVIZ_DOT"зі значенням "C:\Python34\bin\dot.exe", все ще не працюючи. Я спробував видалити Graphviz, а pip uninstall graphvizпотім перевстановити його та встановити pip знову, але нічого не працює.

Ціле повідомлення про зворотний зворотній зв'язок:

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Python34\lib\site-packages\graphviz\files.py", line 220, in render
    proc = subprocess.Popen(cmd, startupinfo=STARTUPINFO)
  File "C:\Python34\lib\subprocess.py", line 859, in __init__
    restore_signals, start_new_session)
  File "C:\Python34\lib\subprocess.py", line 1112, in _execute_child
    startupinfo)
FileNotFoundError: [WinError 2] The system cannot find the file specified

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Users\Documents\Kissmetrics\curves and lines\eventNodes.py", line 56, in <module>
    filename=dot.render(filename='test')
  File "C:\Python34\lib\site-packages\graphviz\files.py", line 225, in render
    'are on your systems\' path' % cmd)
RuntimeError: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'test'], make sure the Graphviz executables are on your systems' path

Хтось має з цим досвід?

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'D:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/'

У Windows просто додайте ці 2 рядки на початку, де "D: / програмні файли (x86) /Graphviz2.38/bin/" замінено адресою, де знаходиться ваш файл біна.

Це вирішує проблему.

Вам слід встановити пакунок graphviz у вашій системі (не лише пакет python). Для Ubuntu слід спробувати:

sudo apt-get install graphviz

Цей вирішив проблему для мене на MAC :

  brew install graphviz

Для Windows:

1. Встановіть пакет Windows з: https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html
2. Встановіть graphvizпакет python
3. Додати C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\binв шлях користувача
4. Додати C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin\dot.exeдо системного шляху

Це працювало для мене!

Спробуйте скористатися:

conda install python-graphviz

Якщо ви користуєтеся програмою graphviz, ви знаходитесь на іншому шляху, ніж ваш каталог conda pip install graphviz.

OSX Sierra, Python 2.7, Graphviz 2.38

Використання pip install graphvizта conda install graphvizBOTH вирішує проблему.

pipотримує лише проблему шляху так само, як і ваш, і condaотримує лише помилку імпорту.

Просто додайте нижче до вашої екологічної змінної (системної) PATH у Windows

C: \ програмні файли (x86) \ Graphviz2.38 \ bin

там ви можете знайти .exe файли

Якщо не працює

Знайдіть папку Graphviz2.38 / bin у своїх програмних файлах, а не в lib python

Потім додайте у свій ПАТ

Важливо знайти папку, де існують файли .exe

Крок 1: Встановіть Graphviz бінарний

Windows:

1. Завантажте Graphviz з http://www.graphviz.org/download/
2. Додайте нижче до змінної середовища PATH (згадайте про встановлену версію graphviz):
   • C: \ програмні файли (x86) \ Graphviz2.38 \ bin
   • C: \ програмні файли (x86) \ Graphviz2.38 \ bin \ dot.exe
3. Закрийте будь-який відкритий зошит Juypter та командний рядок
4. Перезапустіть запит і тест на Jupyter / cmd

Linux:

1. sudo apt-get update
2. sudo apt-get install graphviz
3. або створити його вручну з http://www.graphviz.org/download/

Крок 2: Встановіть графітовий модуль для python

піп:

• pip встановити graphviz

конда:

• конда встановити graphviz

Спробуйте conda install graphviz. У мене була така ж проблема, я вирішив її згаданою командою в MacOS.

Для використання conda install graphvizта conda install python-graphvizвстановлення GraphViz в Windows10 потрібний шлях для мене : C: / ProgramData / Anaconda3 / Library / bin / graphviz / . Тобто додавання

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/ProgramData/Anaconda3/Library/bin/graphviz/'

вирішив для мене питання.

conda install python-graphviz

Для Windows встановіть Python Graphviz, який буде включати виконувані файли в шлях.

У Ubuntu Linux це вирішило для мене:

pip install graphviz
sudo apt-get install graphviz

Ви також можете спробувати conda install -c conda-forge graphvizзамість pip, якщо використовуєте Anaconda.

Вирішуючи це питання для себе, я використав цей підручник з GitHub , який проаналізував причину цієї проблеми. Якщо ми читаємо між рядками, він говорить, що йому потрібна система , а також графік пітона . Крім того conda install, нам потрібно буде запустити:

conda install -c conda-forge python-graphviz

Потім перезавантажте ядро; це працює як шарм.

1) Graphviz - скачайте розпакування в певному місці системи (pip не працює в Windows) і включіть папку bin в шлях ("встановити змінні середовища у windows" АБО), встановлений вручну в кожній програмі

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/GraphViz/bin'

2) Потім поставте модель на побудову

clf = xgb.train(params, d_train, 1000, evals=evallist, early_stopping_rounds=10)
xgb.plot_tree(clf)
plt.rcParams['figure.figsize'] = [50, 10]
plt.show()

Після встановлення пакета ( посилання, якщо ви цього не зробили), додайте шлях до dot.exe як нову системну змінну.

Шлях за замовчуванням:

C: \ програмні файли (x86) \ Graphviz2.38 \ bin \ dot.exe

У мене був той самий випуск на Linux з Jupyter.

Щоб вирішити це, я додав бібліотеку точок до python sys.path

По-перше: перевірте, чи dotвстановлено,

Потім:
знайдіть його шлях whereis dot-> / local / notebook / miniconda2 / envs / ik2 / bin / dot

Нарешті, у сценарії python: sys.path.append ("/ local / notebook / miniconda2 / envs / ik2 / bin / dot")

Спочатку слід скористатися програмою установки pip, а потім завантажити інший пакет на http://www.graphviz.org/Download_windows.php та додати місце встановлення до екологічного шляху, після чого він працює.

У мене було те саме повідомлення про помилку в Mac OS (El Capitan), використовуючи ID ID PyCharm. Я встановив Graphviz за допомогою brew, як це рекомендовано у відповіді RZK, і встановив пакунок graphviz python за допомогою PyCharm (я міг перевірити, чи Graphviz встановлений правильно, спробувавши dot -Vв терміналі та отримавши :) dot - graphviz version 2.40.1 (20161225.0304). Але я все ще отримував повідомлення про помилку при спробі зателефонувати Graphviz з PyCharm.

Мені довелося додати шлях / usr / local / bin в параметри PyCharm, як це рекомендовано у відповіді на це питання, щоб вирішити проблему.

Це показує певну проблему шляху:

pip install graphviz

Отже, це працювало для мене:

sudo apt-get install graphviz

Я перебуваю на macOS Catalina 10.15.3, і у мене була схожа помилка: ExecutableNotFound: failed to execute ['dot', '-Tsvg'], make sure the Graphviz executables are on your systems' PATH

Виправлено це за допомогою:

pip3 install graphviz І brew install graphviz

Зверніть увагу, що pip3 installповідомлення повернеться лише про успіх, Successfully installed graphviz-0.13.2тому нам ще потрібно запустити brew installграфік 2.42.3 (станом на 10 березня 2020 року, 6:00).

Для користувачів Linux, які не мають кореневого доступу, а значить, не можуть використовувати sudo команду, як запропоновано в інших відповідях ...

Спочатку активуйте свою віртуальну середу conda (якщо ви хочете використовувати її):

source activate virtual-env-name

Потім встановіть graphviz, навіть якщо ви вже зробили це за допомогою pip:

conda install graphviz

потім скопіюйте результат наступної команди:

whereis dot

У моєму випадку його вихід:

/home/nader/anaconda2/bin/dot

і додайте його до вашої змінної PATH. Просто запустіть команду нижче

nano ~/.bashrc

і додайте ці рядки до кінця відкритого файлу:

PATH="/home/username/anaconda2/bin/dot:$PATH"
export PATH

тепер натисніть Ctrl+, Oа потім Ctrl+X щоб зберегти та вийти.

Проблему слід вирішити вже зараз.

Користувачі Pycharm, зверніть увагу: Pycharm не завжди бачить змінну PATH такою ж, як у вашого терміналу. Це рішення не працює для Pycharm та, можливо, інших IDE. Але ви можете виправити це, додавши цей рядок коду:

os.environ["PATH"] += os.pathsep + '/home/nader/anaconda2/bin'

до вашої програми python. Не забудь

import os

перший :)

Редагувати: Якщо ви не хочете використовувати conda, ви все одно можете встановити graphviz звідси без кореневих дозволів і додати папку bin до змінної PATH. Я цього не перевіряв.

1.встановіть пакет Windows з: https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html та завантажте файл msi

Додати в змінні середовища 2. Додайте C: \ Program Files (x86) \ Graphviz2.38 \ bin в користувальницький шлях

3. Додати C: \ Program Files (x86) \ Graphviz2.38 \ bin \ dot.exe до системного шляху

4. Перезавантажте ноутбук python.

Це спрацює.

Додайте graphviz до системного шляху

1. Windows - Редагування змінних системного середовища.
2. Виберіть Змінні середовища.
3. Виберіть Шлях - Новий
4. Додайте Шлях графвізу

Наприклад: C: \ Users \ AppData \ Local \ Continuum \ anaconda3 \ Library \ bin \ graphviz

ОС Mojave 10.14., Python 3.6

Використання pip install graphvizотримало хороші відгуки в терміналі, але призвело до цієї помилки, коли я намагався зробити графік у зошиті Юпітера. Потім я побіг brew install graphviz, що дав помилку в терміналі. Потім я побіг conda install graphvizі графік спрацював.

З коментаря @ Leighton: pip отримує лише проблему шляху так само, як і ваш, а conda отримує лише помилку імпорту.

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + "/Macintosh HD⁩/anaconda3⁩/lib⁩/⁨python3.7⁩/site-packages⁩/sphinx⁩/templates⁩/graphviz"

Це вирішило для мене проблему PATH на MAC!

Якщо ви не використовуєте Conda, а ванільний Python, "варити встановити graphviz" працює.

#Write this on anaconda prompt in admin mode
conda install -c anaconda graphviz
conda install -c conda-forge python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/broken python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf201901 python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf202003 python-graphviz

#check dot -v in window's cmd prompt
C:\WINDOWS\system32>dot -V
dot - graphviz version 2.38.0 (20140413.2041)
(this means graphviz installed successfully)

#Add path to sys and user eve variables
PATH
C:\Anaconda3\pkgs\graphviz-2.38-hfd603c8_2\Library\bin
(search bin folder of graphviz and then copy n paste path in env variables)

#Re-run all cmds in jyupter notebook
#if error occurs (less chances)
#then 
#Restart anaconda and again run all cmds in jyupter notebook
eg.
import graphviz as gp
with open("tree.dot") as f:
    dot_read=f.read()
display(gp.Source(dot_read))

спробуйте ввести наступний код у підказку anaconda по черзі.

це працювало для мене.

Джерело: https://anaconda.org/conda-forge/python-graphviz

conda install -c conda-forge python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/broken python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf201901 python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf202003 python-graphviz 

намагаємось це зробити в python import sys! conda install --yes --prefix {sys.prefix} graphviz import graphviz