Як завантажити модель із файлу HDF5 у Keras?


94

Як завантажити модель із файлу HDF5 у Keras?

Що я спробував:

model = Sequential()

model.add(Dense(64, input_dim=14, init='uniform'))
model.add(LeakyReLU(alpha=0.3))
model.add(BatchNormalization(epsilon=1e-06, mode=0, momentum=0.9, weights=None))
model.add(Dropout(0.5))

model.add(Dense(64, init='uniform'))
model.add(LeakyReLU(alpha=0.3))
model.add(BatchNormalization(epsilon=1e-06, mode=0, momentum=0.9, weights=None))
model.add(Dropout(0.5))

model.add(Dense(2, init='uniform'))
model.add(Activation('softmax'))


sgd = SGD(lr=0.1, decay=1e-6, momentum=0.9, nesterov=True)
model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer=sgd)

checkpointer = ModelCheckpoint(filepath="/weights.hdf5", verbose=1, save_best_only=True)
model.fit(X_train, y_train, nb_epoch=20, batch_size=16, show_accuracy=True, validation_split=0.2, verbose = 2, callbacks=[checkpointer])

Наведений вище код успішно зберігає найкращу модель у файлі з назвою weights.hdf5. Що я хочу зробити, це потім завантажити цю модель. У наведеному нижче коді показано, як я намагався це зробити:

model2 = Sequential()
model2.load_weights("/Users/Desktop/SquareSpace/weights.hdf5")

Це помилка, яку я отримую:

IndexError                                Traceback (most recent call last)
<ipython-input-101-ec968f9e95c5> in <module>()
      1 model2 = Sequential()
----> 2 model2.load_weights("/Users/Desktop/SquareSpace/weights.hdf5")

/Applications/anaconda/lib/python2.7/site-packages/keras/models.pyc in load_weights(self, filepath)
    582             g = f['layer_{}'.format(k)]
    583             weights = [g['param_{}'.format(p)] for p in range(g.attrs['nb_params'])]
--> 584             self.layers[k].set_weights(weights)
    585         f.close()
    586 

IndexError: list index out of range

Відповіді:


84

load_weightsлише встановлює ваги вашої мережі. Вам все ще потрібно визначити його архітектуру перед викликом load_weights:

def create_model():
   model = Sequential()
   model.add(Dense(64, input_dim=14, init='uniform'))
   model.add(LeakyReLU(alpha=0.3))
   model.add(BatchNormalization(epsilon=1e-06, mode=0, momentum=0.9, weights=None))
   model.add(Dropout(0.5)) 
   model.add(Dense(64, init='uniform'))
   model.add(LeakyReLU(alpha=0.3))
   model.add(BatchNormalization(epsilon=1e-06, mode=0, momentum=0.9, weights=None))
   model.add(Dropout(0.5))
   model.add(Dense(2, init='uniform'))
   model.add(Activation('softmax'))
   return model

def train():
   model = create_model()
   sgd = SGD(lr=0.1, decay=1e-6, momentum=0.9, nesterov=True)
   model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer=sgd)

   checkpointer = ModelCheckpoint(filepath="/tmp/weights.hdf5", verbose=1, save_best_only=True)
   model.fit(X_train, y_train, nb_epoch=20, batch_size=16, show_accuracy=True, validation_split=0.2, verbose=2, callbacks=[checkpointer])

def load_trained_model(weights_path):
   model = create_model()
   model.load_weights(weights_path)

37
Якщо ви хочете завантажити ПОВНУ модель, а не лише ваги: from keras.models import load_modelтодіmodel = load_model('model.h5')
— cgnorthcutt

1
@mikael, ти можеш дати мені підказку з цим SO повідомленням? stackoverflow.com/questions/55050339 / ...
— HenryHub

207

Якщо ви зберегли повну модель, а не лише ваги, у файлі HDF5, то це так само просто

from keras.models import load_model
model = load_model('model.h5')

чи включає модель фактичні дані навчання також під час обчислення розміру пам'яті моделі? Як ви можете завантажити модель, яка перевищує вашу доступну пам'ять?
— user798719

Модель НЕ (явно) включає дані про навчання. Ви не можете завантажити модель, яка перевищує вашу доступну пам’ять (ну добре, це можливо, але це буде досить складно, і вам доведеться пройти це самостійно ... але якщо ваша модель занадто велика, щоб завантажити вас слід (а) отримати більше пам’яті або (б) навчити меншу модель)
— Мартін Тома

@MartinThoma Я використовую запропонований вами метод. Я намагаюся витягнути один шар із завантаженої моделі і намагаюся побачити, як це важить до: encoder = autoencoder.layers[0] encoder.get_weights() Але я отримую: FailedPreconditionError: Attempting to use uninitialized value lstm_1/kernel
— shubhamsingh

1
Я вдячний за комплімент :-) Щоб підказати прийняту відповідь: я міг уявити, що зберігання лише ваг є надійнішим. Якщо keras зміниться, ваги все ще можуть бути імпортовані, тоді як цілі речі не можуть бути імпортовані. З іншого боку, можна встановити стару версію, скинути ваги і зробити те саме, що і раніше.
— Мартін Тома,

@ pr338 Будь ласка, подумайте про оновлення прийнятої відповіді.
— Kris

28

Дивіться наступний зразок коду про те, як створити базову модель нейронної мережі Keras, зберегти модель (JSON) та ваги (HDF5) та завантажити їх:

# create model
model = Sequential()
model.add(Dense(X.shape[1], input_dim=X.shape[1], activation='relu')) #Input Layer
model.add(Dense(X.shape[1], activation='relu')) #Hidden Layer
model.add(Dense(output_dim, activation='softmax')) #Output Layer

# Compile & Fit model
model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer='adam', metrics=['accuracy'])
model.fit(X,Y,nb_epoch=5,batch_size=100,verbose=1)    

# serialize model to JSON
model_json = model.to_json()
with open("Data/model.json", "w") as json_file:
    json_file.write(simplejson.dumps(simplejson.loads(model_json), indent=4))

# serialize weights to HDF5
model.save_weights("Data/model.h5")
print("Saved model to disk")

# load json and create model
json_file = open('Data/model.json', 'r')
loaded_model_json = json_file.read()
json_file.close()
loaded_model = model_from_json(loaded_model_json)

# load weights into new model
loaded_model.load_weights("Data/model.h5")
print("Loaded model from disk")

# evaluate loaded model on test data 
# Define X_test & Y_test data first
loaded_model.compile(loss='binary_crossentropy', optimizer='adam', metrics=['accuracy'])
score = loaded_model.evaluate(X_test, Y_test, verbose=0)
print ("%s: %.2f%%" % (loaded_model.metrics_names[1], score[1]*100))

1
Це працювало для мене при завантаженні моделі з json та h5. Якщо ви використовуєте приклад @ InheritedGeek, переконайтеся, що ви пам’ятаєте model.compile (). Це потрібно перед тим, як зателефонувати на model.evaluate. Чудовий приклад, спасибі!
— CodeGuyRoss

6

Відповідно до офіційної документації https://keras.io/getting-started/faq/#how-can-i-install-hdf5-or-h5py-to-save-my-models-in-keras

Ви можете зробити :

перший тест, якщо у вас встановлено h5py, запустивши

import h5py

якщо під час імпорту h5py у вас не виникає помилок, ви можете заощадити:

from keras.models import load_model

model.save('my_model.h5')  # creates a HDF5 file 'my_model.h5'
del model  # deletes the existing model

# returns a compiled model
# identical to the previous one
model = load_model('my_model.h5')

Якщо вам потрібно встановити h5py http://docs.h5py.org/en/latest/build.html


3
Здається, це не працює в Keras 2.2.4 з h5py 2.9.0. Я отримую таку помилку: Anaconda3 \ envs \ синтетичний \ lib \ site-пакети \ keras \ utils \ io_utils.py ", рядок 302, у getitem raise ValueError ('Не вдається створити групу в режимі лише для читання.')
— csteel

0

Я зробив таким чином

from keras.models import Sequential
from keras_contrib.losses import import crf_loss
from keras_contrib.metrics import crf_viterbi_accuracy

# To save model
model.save('my_model_01.hdf5')

# To load the model
custom_objects={'CRF': CRF,'crf_loss': crf_loss,'crf_viterbi_accuracy':crf_viterbi_accuracy}

# To load a persisted model that uses the CRF layer 
model1 = load_model("/home/abc/my_model_01.hdf5", custom_objects = custom_objects)

немає моделі.save (). Існує лише model.model.save (). І завантаження цієї моделі назад і використання її в оригінально створеній моделі призводить до помилок. Завантажений об’єкт - <keras.engine.sequential.Sequential Хоча створеним нами є keras.wrappers.scikit_learn.KerasRegressor. Як я можу це змінити?
— пісок

Я вирішив свою проблему на наведеному нижче сайті [ github.com/keras-team/keras-contrib/blob/master/keras_contrib/…
— TRINADH NAGUBADI

Я отримав 404 за цим посиланням
— пісок


@TRINADH NAGUBADI, оновіть посилання, будь ласка, сторінки більше не існує.
— Каталіна Чірку
Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.