Як перетворити дані з об’єкта Scikit-learn Bunch у Pandas DataFrame?
from sklearn.datasets import load_iris
import pandas as pd
data = load_iris()
print(type(data))
data1 = pd. # Is there a Pandas method to accomplish this?
Як перетворити дані з об’єкта Scikit-learn Bunch у Pandas DataFrame?
from sklearn.datasets import load_iris
import pandas as pd
data = load_iris()
print(type(data))
data1 = pd. # Is there a Pandas method to accomplish this?
Відповіді:
Вручну ви можете використовувати pd.DataFrame
конструктор, надаючи масив numpy ( data
) і список імен стовпців ( columns
). Щоб мати все в одному DataFrame, ви можете об'єднати функції та ціль в один масив numpy за допомогою np.c_[...]
(зверніть увагу []
):
import numpy as np
import pandas as pd
from sklearn.datasets import load_iris
# save load_iris() sklearn dataset to iris
# if you'd like to check dataset type use: type(load_iris())
# if you'd like to view list of attributes use: dir(load_iris())
iris = load_iris()
# np.c_ is the numpy concatenate function
# which is used to concat iris['data'] and iris['target'] arrays
# for pandas column argument: concat iris['feature_names'] list
# and string list (in this case one string); you can make this anything you'd like..
# the original dataset would probably call this ['Species']
data1 = pd.DataFrame(data= np.c_[iris['data'], iris['target']],
columns= iris['feature_names'] + ['target'])
load_boston()
. Ця відповідь працює в більш загальному плані : stackoverflow.com/a/46379878/1840471
from sklearn.datasets import load_iris
import pandas as pd
data = load_iris()
df = pd.DataFrame(data.data, columns=data.feature_names)
df.head()
Цей підручник може зацікавити: http://www.neural.cz/dataset-exploration-boston-house-pricing.html
Рішення TOMDLt недостатньо загальне для всіх наборів даних у scikit-learn. Наприклад, це не працює для набору даних про житло в Бостоні. Я пропоную інше рішення, яке є більш універсальним. Не потрібно також використовувати numpy.
from sklearn import datasets
import pandas as pd
boston_data = datasets.load_boston()
df_boston = pd.DataFrame(boston_data.data,columns=boston_data.feature_names)
df_boston['target'] = pd.Series(boston_data.target)
df_boston.head()
Як загальна функція:
def sklearn_to_df(sklearn_dataset):
df = pd.DataFrame(sklearn_dataset.data, columns=sklearn_dataset.feature_names)
df['target'] = pd.Series(sklearn_dataset.target)
return df
df_boston = sklearn_to_df(datasets.load_boston())
Як альтернатива, яку я міг би обернути головою набагато простіше:
data = load_iris()
df = pd.DataFrame(data['data'], columns=data['feature_names'])
df['target'] = data['target']
df.head()
Взагалі замість конкатенації з самого початку просто створіть фрейм даних з матрицею функцій, а потім просто додайте цільовий стовпець з даними ['whatvername'] і захопіть цільові значення з набору даних
Мені знадобилося 2 години, щоб це зрозуміти
import numpy as np
import pandas as pd
from sklearn.datasets import load_iris
iris = load_iris()
##iris.keys()
df= pd.DataFrame(data= np.c_[iris['data'], iris['target']],
columns= iris['feature_names'] + ['target'])
df['species'] = pd.Categorical.from_codes(iris.target, iris.target_names)
Поверніть вид для моїх панд
В іншому випадку використовуйте набори даних seaborn, які є фактичними кадрами даних панд:
import seaborn
iris = seaborn.load_dataset("iris")
type(iris)
# <class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
Порівняйте з наборами даних scikit learn:
from sklearn import datasets
iris = datasets.load_iris()
type(iris)
# <class 'sklearn.utils.Bunch'>
dir(iris)
# ['DESCR', 'data', 'feature_names', 'filename', 'target', 'target_names']
Це працює для мене.
dataFrame = pd.dataFrame(data = np.c_[ [iris['data'],iris['target'] ],
columns=iris['feature_names'].tolist() + ['target'])
Інший спосіб поєднання ознак та цільових змінних може бути використання np.column_stack
( детально )
import numpy as np
import pandas as pd
from sklearn.datasets import load_iris
data = load_iris()
df = pd.DataFrame(np.column_stack((data.data, data.target)), columns = data.feature_names+['target'])
print(df.head())
Результат:
sepal length (cm) sepal width (cm) petal length (cm) petal width (cm) target
0 5.1 3.5 1.4 0.2 0.0
1 4.9 3.0 1.4 0.2 0.0
2 4.7 3.2 1.3 0.2 0.0
3 4.6 3.1 1.5 0.2 0.0
4 5.0 3.6 1.4 0.2 0.0
Якщо вам потрібен ярлик рядки для target
, то ви можете використовувати replace
шляхом перетворення target_names
в dictionary
і додати новий стовпець:
df['label'] = df.target.replace(dict(enumerate(data.target_names)))
print(df.head())
Результат:
sepal length (cm) sepal width (cm) petal length (cm) petal width (cm) target label
0 5.1 3.5 1.4 0.2 0.0 setosa
1 4.9 3.0 1.4 0.2 0.0 setosa
2 4.7 3.2 1.3 0.2 0.0 setosa
3 4.6 3.1 1.5 0.2 0.0 setosa
4 5.0 3.6 1.4 0.2 0.0 setosa
В основному вам потрібні "дані", і вони є у вас в пучку scikit, тепер вам потрібна просто "ціль" (передбачення), яка також є в групі.
Тож просто потрібно поєднати ці два, щоб зробити дані повними
data_df = pd.DataFrame(cancer.data,columns=cancer.feature_names)
target_df = pd.DataFrame(cancer.target,columns=['target'])
final_df = data_df.join(target_df)
Починаючи з версії 0.23, ви можете безпосередньо повернути DataFrame, використовуючи as_frame
аргумент. Наприклад, завантаження набору даних райдужки:
from sklearn.datasets import load_iris
iris = load_iris(as_frame=True)
df = iris.data
На моє розуміння, використовуючи попередні примітки до випуску , це працює для набору даних breast_cancer, diabetes, digits, iris, linnerud, wine та california_houses.
Ви можете використовувати параметр as_frame=True
для отримання фреймів даних pandas.
from sklearn import datasets
X,y = datasets.load_iris(return_X_y=True) # numpy arrays
dic_data = datasets.load_iris(as_frame=True)
print(dic_data.keys())
df = dic_data['frame'] # pandas dataframe data + target
df_X = dic_data['data'] # pandas dataframe data only
ser_y = dic_data['target'] # pandas series target only
dic_data['target_names'] # numpy array
from sklearn import datasets
fnames = [ i for i in dir(datasets) if 'load_' in i]
print(fnames)
fname = 'load_boston'
loader = getattr(datasets,fname)()
df = pd.DataFrame(loader['data'],columns= loader['feature_names'])
df['target'] = loader['target']
df.head(2)
Опрацюючи найкращу відповідь та звернувшись до мого коментаря, ось функція перетворення
def bunch_to_dataframe(bunch):
fnames = bunch.feature_names
features = fnames.tolist() if isinstance(fnames, np.ndarray) else fnames
features += ['target']
return pd.DataFrame(data= np.c_[bunch['data'], bunch['target']],
columns=features)
Що б TomDLT не відповів, це може не спрацювати для деяких з вас, тому що
data1 = pd.DataFrame(data= np.c_[iris['data'], iris['target']],
columns= iris['feature_names'] + ['target'])
оскільки iris ['feature_names'] повертає вам масив numpy. У масиві numpy ви не можете додати масив і список ['target'] лише оператором +. Отже, вам потрібно спочатку перетворити його у список, а потім додати.
Ви можете зробити
data1 = pd.DataFrame(data= np.c_[iris['data'], iris['target']],
columns= list(iris['feature_names']) + ['target'])
Це буде добре працювати ..
Може бути кращий спосіб, але ось те, що я робив у минулому, і це працює досить добре:
items = data.items() #Gets all the data from this Bunch - a huge list
mydata = pd.DataFrame(items[1][1]) #Gets the Attributes
mydata[len(mydata.columns)] = items[2][1] #Adds a column for the Target Variable
mydata.columns = items[-1][1] + [items[2][0]] #Gets the column names and updates the dataframe
Тепер у mydata буде все необхідне - атрибути, цільові змінні та імена стовпців
mydata = pd.DataFrame(items[1][1])
кидкиTypeError: 'dict_items' object does not support indexing
Цей фрагмент - це лише синтаксичний цукор, побудований на тому, що TomDLT і rolyat вже внесли та пояснили. Єдиною різницею буде те, що load_iris
замість словника повернеться кортеж, а імена стовпців перераховані.
df = pd.DataFrame(np.c_[load_iris(return_X_y=True)])
import pandas as pd
from sklearn.datasets import load_iris
iris = load_iris()
X = iris['data']
y = iris['target']
iris_df = pd.DataFrame(X, columns = iris['feature_names'])
iris_df.head()
Один з найкращих способів:
data = pd.DataFrame(digits.data)
Digits - це фрейм даних sklearn, і я перетворив його на pandas DataFrame
Я взяв кілька ідей з ваших відповідей, і не знаю, як це зробити коротше :)
import pandas as pd
from sklearn.datasets import load_iris
iris = load_iris()
df = pd.DataFrame(iris.data, columns=iris['feature_names'])
df['target'] = iris['target']
Це дає Pandas DataFrame з іменами_функцій плюс ціль як стовпці та RangeIndex (start = 0, stop = len (df), step = 1). Я хотів би мати коротший код, куди я можу безпосередньо додати "ціль".
API трохи чистіший, ніж запропоновані відповіді. Тут, використовуючи as_frame
та обов’язково включивши також стовпець відповідей.
import pandas as pd
from sklearn.datasets import load_wine
features, target = load_wine(as_frame=True).data, load_wine(as_frame=True).target
df = features
df['target'] = target
df.head(2)
from sklearn.datasets import load_iris
import pandas as pd
iris_dataset = load_iris()
datasets = pd.DataFrame(iris_dataset['data'], columns =
iris_dataset['feature_names'])
target_val = pd.Series(iris_dataset['target'], name =
'target_values')
species = []
for val in target_val:
if val == 0:
species.append('iris-setosa')
if val == 1:
species.append('iris-versicolor')
if val == 2:
species.append('iris-virginica')
species = pd.Series(species)
datasets['target'] = target_val
datasets['target_name'] = species
datasets.head()