Як використовувати R із Google Colaboratory?

Google Colaboratory підтримує версії Python 2.7 і 3.6

Я бачу приклад, як використовувати Swift у Colab деякий час тому.

Сьогодні я випадково побіг

!jupyter-kernelspec list

І знайшов нове ядро: IRkernel

Available kernels:
  ir         /usr/local/share/jupyter/kernels/ir
  python2    /usr/local/share/jupyter/kernels/python2
  python3    /usr/local/share/jupyter/kernels/python3
  swift      /usr/local/share/jupyter/kernels/swift

Чи можна зараз використовувати R і в Colab? Немає клопоту з установкою ядра R?

Так.

Для нового ноутбука R використовуйте це посилання . (скорочення - colab.to/r )

Ви можете дізнатись у демонстраційних програмах IRkernel, наприклад demo.ipynb

Збережіть копію на своєму Диску Google і внесіть необхідні зміни.

Ще 2 демонстраційні версії:

• Display.ipynb показує, як відображати HTML, зображення.
• Comm_Demo.ipynb показує, як взаємодіяти між R та JavaScript.

Детальніше див. У IRkernel Github .

Якщо ви хочете використовувати Python і R разом, ви можете використовувати R magic для деяких клітинок.

# activate R magic
%load_ext rpy2.ipython

Потім, коли ви хочете використовувати R, ви починаєте клітинку з %%R

%%R
x <- 42
print(x)

Детальніше в документації до rpy2

Відкрийте це посилання у своєму браузері, щоб створити новий блокнот із ядром R

https://colab.research.google.com/notebook#create=true&language=r

Щоб розширити попередню відповідь, ось як можна переміщати кадри даних між ядрами R та Python, щоб ви могли працювати з обома в одному блокноті (наприклад, якщо ви хочете завантажити дані в Pandas, обробіть їх за допомогою пакета R, а потім побудуйте це з Боке).

# Pandas dataframe to R data frame
!pip3 install rpy2
%load_ext rpy2.ipython
%R -i df

# R data frame to Pandas dataframe
%R seq.data <- read.delim('sequence.index', header=TRUE, stringsAsFactors=FALSE)
seq_data = %R seq.data

Оновлення: це вже не працює (липень 2020) .

Наведене вище посилання на відповіді вище переходить безпосередньо до ноутбука R, там ви можете змінити параметр між R або python. Дивно, що Google змінює послуги саме так. Отже, stackoverflow не є чудовою платформою для просування інструментів, створених компаніями, що стимулюють прибуток / продають дані.

Стара відповідь:

На сьогоднішній день, якщо натиснути Runtimeна рядку меню, а потім вибрати Change Runtime Type, ви можете вибрати між R або Python.

***** Працює станом на п'ятницю 13 листопада 2020 року

Перейдіть за цією URL-адресою https://colab.to/r, поки ви ввійшли в colab, і це має зробити це.

Ви можете перевірити, чи R у Runtime -> Змінити тип виконання, але це вже має бути налаштовано.

Щоб встановити Google Drive:

install.packages("googledrive")
library("googledrive")

if (file.exists("/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/google/colab/_ipython.py")){ 
  install.packages("R.utils")
  library("R.utils")
  library("httr")
  my_check <- function() {return(TRUE)}
  reassignInPackage("is_interactive", pkgName = "httr", my_check)
  options(rlang_interactive=TRUE)
}                                                                                    

І автентифікуйте Google Drive

drive_auth(use_oob = TRUE, cache = TRUE)

Ще один швидкий спосіб - замінити postix, .ipynb у заголовку colab на .r
Приклад: змінити ім'я Untitled.ipynb на Untitled.r, і все працює чудово!