Зразок випадкових рядків у кадрі даних


333

Я намагаюся знайти відповідну функцію, яка б повернула задану кількість рядків, зібраних випадковим чином, без заміни з кадру даних мовою R? Хтось може мені допомогти?

Відповіді:


445

Спочатку внесіть деякі дані:

> df = data.frame(matrix(rnorm(20), nrow=10))
> df
           X1         X2
1   0.7091409 -1.4061361
2  -1.1334614 -0.1973846
3   2.3343391 -0.4385071
4  -0.9040278 -0.6593677
5   0.4180331 -1.2592415
6   0.7572246 -0.5463655
7  -0.8996483  0.4231117
8  -1.0356774 -0.1640883
9  -0.3983045  0.7157506
10 -0.9060305  2.3234110

Потім виберіть випадково кілька рядків:

> df[sample(nrow(df), 3), ]
           X1         X2
9  -0.3983045  0.7157506
2  -1.1334614 -0.1973846
10 -0.9060305  2.3234110

4
@nikhil Дивіться тут і тут для початку. Ви також можете ввести ?sampleконсоль R, щоб прочитати про цю функцію.
— Joran

10
Чи може хтось пояснити, чому зразок (df, 3) не працює? Для чого вам потрібен df [sample (nrow (df), 3),]?
— stackoverflowuser2010

5
@ stackoverflowuser2010, ви можете набрати? sample та побачити, що перший аргумент у функції вибірки повинен бути векторним чи додатним цілим числом. Я не думаю, що data.frame в цьому випадку працює як вектор.
— Девід Браун

9
Не забудьте встановити насіння (наприклад set.seed(42)) щоразу, коли ви хочете відтворити цей конкретний зразок.
— CousinCocaine

2
sample.intбуде трохи швидше, я вважаю:library(microbenchmark);microbenchmark( sample( 10000, 100 ), sample.int( 10000, 100 ), times = 10000 )
— Арі Б. Фрідман

199

Відповідь, яку дає Джон Колбі, - це правильна відповідь. Однак якщо ви dplyrкористувач, є також відповідь sample_n:

sample_n(df, 10)

випадковим чином відбирає 10 рядків з фрейму даних. Він викликає дзвінки sample.int, тому насправді це одна і та ж відповідь з меншим типом (і спрощує використання в контексті magrittr, оскільки фрейм даних є першим аргументом).


33

Напишіть одну! Відповідь JC, що перегортає, дає мені:

randomRows = function(df,n){
   return(df[sample(nrow(df),n),])
}

Тепер краще зробити це, перевіривши спочатку, якщо n <= nrow (df), і зупинившись з помилкою.


33

data.tableПакет надає функцію DT[sample(.N, M)], вибірки М випадкових рядків з таблиці даних DT.

library(data.table)
set.seed(10)

mtcars <- data.table(mtcars)
mtcars[sample(.N, 6)]

    mpg cyl  disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb
1: 14.7   8 440.0 230 3.23 5.345 17.42  0  0    3    4
2: 19.2   6 167.6 123 3.92 3.440 18.30  1  0    4    4
3: 17.3   8 275.8 180 3.07 3.730 17.60  0  0    3    3
4: 21.5   4 120.1  97 3.70 2.465 20.01  1  0    3    1
5: 22.8   4 108.0  93 3.85 2.320 18.61  1  1    4    1
6: 15.5   8 318.0 150 2.76 3.520 16.87  0  0    3    2

10

Просто заради повноти:

dplyr також пропонує намалювати пропорцію або частку вибірки за

df %>% sample_frac(0.33)

Це дуже зручно, наприклад, при машинному навчанні, коли вам потрібно виконати певний коефіцієнт розділення, наприклад 80%: 20%


9

EDIT : Ця відповідь застаріла, дивіться оновлену версію .

У своєму пакеті R я вдосконалив, sampleтак що тепер він поводиться так, як очікувалося, і для кадрів даних:

library(devtools); install_github('kimisc', 'krlmlr')

library(kimisc)
example(sample.data.frame)

smpl..> set.seed(42)

smpl..> sample(data.frame(a=c(1,2,3), b=c(4,5,6),
                           row.names=c('a', 'b', 'c')), 10, replace=TRUE)
    a b
c   3 6
c.1 3 6
a   1 4
c.2 3 6
b   2 5
b.1 2 5
c.3 3 6
a.1 1 4
b.2 2 5
c.4 3 6

Це досягається шляхом створення sampleзагального методу S3 та надання необхідної (тривіальної) функціональності функції. Заклик setMethodвиправити все. До оригінальної реалізації все ще можна отримати доступ base::sample.


1
Що несподіваного щодо обробки кадрів даних?
— інший бен

2
@adifferentben: Коли я закликаю sample.default(df, ...)кадр даних df, він вибирає з стовпців кадру даних, оскільки кадр даних реалізований у вигляді списку векторів однакової довжини.
— krlmlr

Ваш пакет все ще доступний? Я побіг install_github('kimisc', 'krlmlr')і дістався Error: Does not appear to be an R package (no DESCRIPTION). Як-небудь навколо цього?
— тердон

1
@JorisMeys: Погоджено, за винятком частини "як очікувалося". Тільки тому, що кадр даних реалізований як список внутрішньо, це не означає, що він повинен вести себе як єдиний. [Оператор кадрів даних контрприклад. Також скажіть, будь ласка: Ви коли-небудь, лише один раз, використовували sampleдля вибірки стовпців із фрейму даних?
— krlmlr

1
@krlmlr Оператор [не є контрприкладом: iris[2]працює як список, як і iris[[2]]. Або iris$Species, lapply(iris, mean)... Кадри даних списків. Тож я очікую, що вони поводяться як вони. І так, я фактично використовував зразок (myDataframe). На наборі даних, де кожна змінна містить дані експресії одного гена. Ваш конкретний метод допомагає початківцям користувачам, але також ефективно змінює спосіб sample()поведінки. Примітка Я використовую "як очікувалося" з точки зору програміста. Що відрізняється від загальної інтуїції. У R дуже багато, що не сумісне із загальною інтуїцією ...;)
— Joris Meys

8

Застаріла відповідь. Будь ласка, використовуйте dplyr::sample_frac()або dplyr::sample_n()замість цього.

У моєму пакеті R є функція sample.rowsсаме для цієї мети:

install.packages('kimisc')

library(kimisc)
example(sample.rows)

smpl..> set.seed(42)

smpl..> sample.rows(data.frame(a=c(1,2,3), b=c(4,5,6),
                               row.names=c('a', 'b', 'c')), 10, replace=TRUE)
    a b
c   3 6
c.1 3 6
a   1 4
c.2 3 6
b   2 5
b.1 2 5
c.3 3 6
a.1 1 4
b.2 2 5
c.4 3 6

Покращення sample, зробивши його загальною функцією S3, було поганою ідеєю, згідно з коментарями Йорзіс Мейс до попередньої відповіді .


5

Виберіть випадковий зразок із типу тиблизи в R:

library("tibble")    
a <- your_tibble[sample(1:nrow(your_tibble), 150),]

nrow приймає таблицю і повертає кількість рядків. Перший переданий параметр sample- це діапазон від 1 до кінця таблиці. Другий параметр, переданий для вибірки, 150, - це кількість випадкових вибірок. Нарізка квадратної дужки вказує рядки повернених індексів. Змінна 'a' отримує значення випадкової вибірки.


3

Ви можете це зробити:

library(dplyr)

cols <- paste0("a", 1:10)
tab <- matrix(1:1000, nrow = 100) %>% as.tibble() %>% set_names(cols)
tab
# A tibble: 100 x 10
      a1    a2    a3    a4    a5    a6    a7    a8    a9   a10
   <int> <int> <int> <int> <int> <int> <int> <int> <int> <int>
 1     1   101   201   301   401   501   601   701   801   901
 2     2   102   202   302   402   502   602   702   802   902
 3     3   103   203   303   403   503   603   703   803   903
 4     4   104   204   304   404   504   604   704   804   904
 5     5   105   205   305   405   505   605   705   805   905
 6     6   106   206   306   406   506   606   706   806   906
 7     7   107   207   307   407   507   607   707   807   907
 8     8   108   208   308   408   508   608   708   808   908
 9     9   109   209   309   409   509   609   709   809   909
10    10   110   210   310   410   510   610   710   810   910
# ... with 90 more rows

Нагорі я лише зробив кадр даних з 10 стовпцями та 100 рядками, добре?

Тепер ви можете спробувати його за допомогою sample_n:

sample_n(tab, size = 800, replace = T)
# A tibble: 800 x 10
      a1    a2    a3    a4    a5    a6    a7    a8    a9   a10
   <int> <int> <int> <int> <int> <int> <int> <int> <int> <int>
 1    53   153   253   353   453   553   653   753   853   953
 2    14   114   214   314   414   514   614   714   814   914
 3    10   110   210   310   410   510   610   710   810   910
 4    70   170   270   370   470   570   670   770   870   970
 5    36   136   236   336   436   536   636   736   836   936
 6    77   177   277   377   477   577   677   777   877   977
 7    13   113   213   313   413   513   613   713   813   913
 8    58   158   258   358   458   558   658   758   858   958
 9    29   129   229   329   429   529   629   729   829   929
10     3   103   203   303   403   503   603   703   803   903
# ... with 790 more rows

1

Я новачок в R, але я використовував цей простий метод, який працює для мене:

sample_of_diamonds <- diamonds[sample(nrow(diamonds),100),]

PS: Не соромтесь зауважувати, чи є у нього якийсь недолік, про який я не думаю.


Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.