Чи є якась користь від компіляції LAPACK з джерела порівняно з встановленням попередньо вбудованого пакету від Ubuntu?

13

Я знаю, що ATLAS здатний оптимізувати себе для машини, на якій вона компілюється, і, таким чином, максимальні переваги знаходять, компілюючи з джерела. Чи є якась користь від компіляції LAPACK з джерела? Набагато простіше було б просто встановити попередньо вбудований пакет.

performance lapack

— OSE
джерело

Можливо, варто спробувати цю техніку, щоб побачити, чому саме витрачається час. Я виявив, що якщо я багато працюю з не великими матрицями, підпрограми бібліотеки витрачають більше половини свого часу, класифікуючи свої вхідні символи та інші класифікації вводу, тож ви можете отримати велику швидкість, збільшивши бібліотеку з кількома добре підібраними ручними програмами.

— Майк Данлаве

9

OpenBlas досить швидкий, тому ви можете пов’язати його з LAPACK. Ви спробували попередньо складену версію LAPACK / BLAS від свого постачальника процесорів? Наприклад, AMD ACML (безкоштовно) або Intel MKL (безкоштовно в Linux для некомерційного та неакадемічного використання)? Вам просто потрібно розпакувати та запустити інсталяційний файл.

На мою думку, єдиною перевагою використання ATLAS є використання незвичайних процесорів. В іншому випадку використовуйте той у постачальника процесора. Також доступні версії nVIDIA CUDA та AMD OpenCL, які справді гойдаються.

EDIT: пам’ятайте, що ви завжди можете створити пакет Ubuntu DEB з джерела, що зазвичай набагато простіше, ніж компілювати програмне забезпечення з джерела.

— Біда
джерело

Я думаю, я піду з вашою пропозицією та встановіть MKL. Також дякую за пораду щодо створення пакетів DEB, я не знав, що це можливо.

— OSE

2

Пам’ятайте, що вам потрібно налаштувати ld (динамічний лінкер бібліотек, щоб мати змогу знайти ці файли). BLAS та LAPACK від Intel MKL є у libmkl_rt.soфайлі, який зазвичай пов'язують, використовуючи:-L/opt/intel/mkl/lib/intel64 -lmkl_rt

— Misery

2

Слід зазначити, що некомерційна ліцензія Intel з кожним випуском стає все більш обмежуючою, до того моменту, коли вони дуже чітко пояснюють те, що академічне використання не покривається ним, як тільки ви отримуєте гроші на свої дослідження.

— Крістіан Класон

Та ще, що варто згадати. Однак можна протестувати це безкоштовно:] І якщо це виявиться корисним, це не найдорожча річ у світі.

— бід

7

Пакет сховища не є безпечним для використання з потоком через спосіб його складання. Я повідомив про помилку на форумі Lapack , але пройде багато часу, щоб вирішити способи вирішення чи вирішення проблем у сховище. Якщо ви складете його самостійно, не забудьте додати «gfrankv» до gfortran.

— Віктор Лю
джерело

6

На мій досвід, найкращий спосіб використання blas / lapack в останніх версіях ubuntu - це використання упакованих openblas.

Для чого це варто, я здебільшого використовую blas / lapack через python numpy / scipy, а використання openblas прискорює деяку лінійну алгебру на зразок 200x проти типового. Я намагався використовувати користувальницький ATLAS, але це був величезний біль і не давав багато, якщо якісь прискорення порівняно з openblas, але я, можливо, робив це неправильно.

— кліпер
джерело