Ну - ні.
Використання роботи інших людей дуже важливо на шляху до будь-якого успіху. Створюючи деяке програмне забезпечення з джерела (tarball), ви упускаєте можливість використовувати роботу диспетчера пакунків дистрибутива.
Ви не отримаєте "безкоштовних" оновлень. Більшість випадків ніхто не оновлює пакунки, встановлені ними з джерела. Оскільки їм потрібно відслідковувати програмне забезпечення для нових версій, відновити його та всі залежні програми (спробуйте запам’ятати їх).
У вас виникнуть проблеми з іншими пакунками з репостів вашого розповсюдження. Саме такий випадок зазначений у запитанні: ubuntu має чудового менеджера пакунків та декількох дуже приємних людей, які підтримують пакунки. І вони вирішили, що для роботи програми mailx вам потрібен MTA. Отже, якщо ви встановили постфікс із джерел, ubuntu не просить вас встановити exim.
Якщо з якихось причин обслуговування сервера переходить на якусь іншу людину (наприклад, ваш проект стає дуже успішним, і ви вирішите найняти іншого хлопця, який керуватиме серверами, поки ви зайняті іншими речами), він, природно, розраховує працювати, dpkg --get-selections
щоб отримати всі встановлені пакети.
Спробуйте якомога більше використовувати програмне забезпечення для управління пакетами. Навчіться створювати власні пакети, якщо ви не зможете знайти одного попередньо побудованого і ви станете кращим професіоналом.