Повільний доступ до файлової системи

Я намагаюся діагностувати повільну проблему файлової системи на сервері, за яким я доглядаю. Це триває вже досить довго, і у мене не вистачає ідей щодо того, що я можу спробувати. Ось товста вона.

Сам сервер - це Dell Poweredge T310. У ньому є 4 жорсткі диски SAS, налаштовані на RAID5 і працює Citrix XenServer 5.6. VM - це (відносно) стара установка Debian 5.0.6. Дано 4 ядра і 4 Гб оперативної пам’яті. Він має 3 томи. Об'єм 10Gb (ext3) для системи, об'єм 980Gb (xfs) для даних (~ 94% повно) і ще об'єм 200Gb (xfs) для даних (~ 13% повно).

Тепер ось дивна річ. Доступ для читання / запису до гучності 980Gb дійсно повільний. Я можу отримати 5 Мбіт / с, якщо мені пощастить. Спочатку я подумав, що це насправді доступ до диска в системі або на рівні гіпервізора, але виключив, що цілком, як і інші VM на тому ж хості, працює нормально (хороша пара сотень Мб / с диск / г доступ). Тоді я почав орієнтуватися саме на цей ВМ. Я почав думати, що це XFS, але, щоб довести це, я не збирався намагатися змінити файлову систему на 980 Гбіт диск з роками та роками мільярдів файлів. Тож я забезпечив накопичувач на 200 Гбіт і зробив те саме тест на читання / запис (в основному, дд), і отримав хороший пару сотень Мб / с / ш / доступ до нього. Таким чином, це виключило VM, апаратне забезпечення та тип файлової системи.

Їх також багато в /var/log/kern.log; (вибачте, це досить довго)

Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564689] httpd: page allocation failure. order:5, mode:0x4020
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564693] Pid: 7318, comm: httpd Not tainted 2.6.32-4-686-bigmem #1
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564696] Call Trace:
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564705]  [<c1092a4d>] ? __alloc_pages_nodemask+0x476/0x4e0
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564711]  [<c1092ac3>] ? __get_free_pages+0xc/0x17
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564716]  [<c10b632e>] ? __kmalloc+0x30/0x128
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564722]  [<c11dd774>] ? pskb_expand_head+0x4f/0x157
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564727]  [<c11ddbbf>] ? __pskb_pull_tail+0x41/0x1fb
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564732]  [<c11e4882>] ? dev_queue_xmit+0xe4/0x38e
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564738]  [<c1205902>] ? ip_finish_output+0x0/0x5c
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564742]  [<c12058c7>] ? ip_finish_output2+0x187/0x1c2
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564747]  [<c1204dc8>] ? ip_local_out+0x15/0x17
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564751]  [<c12055a9>] ? ip_queue_xmit+0x31e/0x379
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564758]  [<c1279a90>] ? _spin_lock_bh+0x8/0x1e
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564767]  [<eda15a8d>] ? __nf_ct_refresh_acct+0x66/0xa4 [nf_conntrack]
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564773]  [<c103bf42>] ? _local_bh_enable_ip+0x16/0x6e
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564779]  [<c1214593>] ? tcp_transmit_skb+0x595/0x5cc
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564785]  [<c1005c4f>] ? xen_restore_fl_direct_end+0x0/0x1
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564791]  [<c12165ea>] ? tcp_write_xmit+0x7a3/0x874
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564796]  [<c121203a>] ? tcp_ack+0x1611/0x1802
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564801]  [<c10055ec>] ? xen_force_evtchn_callback+0xc/0x10
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564806]  [<c121392f>] ? tcp_established_options+0x1d/0x8b
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564811]  [<c1213be4>] ? tcp_current_mss+0x38/0x53
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564816]  [<c1216701>] ? __tcp_push_pending_frames+0x1e/0x50
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564821]  [<c1212246>] ? tcp_data_snd_check+0x1b/0xd2
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564825]  [<c1212de3>] ? tcp_rcv_established+0x5d0/0x626
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564831]  [<c121902c>] ? tcp_v4_do_rcv+0x15f/0x2cf
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564835]  [<c1219561>] ? tcp_v4_rcv+0x3c5/0x5c0
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564841]  [<c120197e>] ? ip_local_deliver_finish+0x10c/0x18c
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564846]  [<c12015a4>] ? ip_rcv_finish+0x2c4/0x2d8
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564852]  [<c11e3b71>] ? netif_receive_skb+0x3bb/0x3d6
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564864]  [<ed823efc>] ? xennet_poll+0x9b8/0xafc [xen_netfront]
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564869]  [<c11e40ee>] ? net_rx_action+0x96/0x194
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564874]  [<c103bd4c>] ? __do_softirq+0xaa/0x151
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564878]  [<c103be24>] ? do_softirq+0x31/0x3c
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564883]  [<c103befa>] ? irq_exit+0x26/0x58
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564890]  [<c118ff9f>] ? xen_evtchn_do_upcall+0x12c/0x13e
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564896]  [<c1008c3f>] ? xen_do_upcall+0x7/0xc
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564899] Mem-Info:
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564902] DMA per-cpu:
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564905] CPU    0: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564908] CPU    1: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564911] CPU    2: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564914] CPU    3: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564916] Normal per-cpu:
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564919] CPU    0: hi:  186, btch:  31 usd: 175
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564922] CPU    1: hi:  186, btch:  31 usd: 165
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564925] CPU    2: hi:  186, btch:  31 usd:  30
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564928] CPU    3: hi:  186, btch:  31 usd: 140
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564931] HighMem per-cpu:
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564933] CPU    0: hi:  186, btch:  31 usd: 159
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564936] CPU    1: hi:  186, btch:  31 usd:  22
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564939] CPU    2: hi:  186, btch:  31 usd:  24
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564942] CPU    3: hi:  186, btch:  31 usd:  13
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564947] active_anon:485974 inactive_anon:121138 isolated_anon:0
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564948]  active_file:75215 inactive_file:79510 isolated_file:0
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564949]  unevictable:0 dirty:516 writeback:15 unstable:0
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564950]  free:230770 slab_reclaimable:36661 slab_unreclaimable:21249
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564952]  mapped:20016 shmem:29450 pagetables:5600 bounce:0
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564958] DMA free:2884kB min:72kB low:88kB high:108kB active_anon:0kB inactive_anon:0kB active_file:5692kB inactive_file:724kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:15872kB mlocked:0kB dirty:8kB writeback:0kB mapped:0kB shmem:0kB slab_reclaimable:5112kB slab_unreclaimable:156kB kernel_stack:56kB pagetables:0kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:0 all_unreclaimable? no
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564964] lowmem_reserve[]: 0 698 4143 4143
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564977] Normal free:143468kB min:3344kB low:4180kB high:5016kB active_anon:56kB inactive_anon:2068kB active_file:131812kB inactive_file:131728kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:715256kB mlocked:0kB dirty:156kB writeback:0kB mapped:308kB shmem:4kB slab_reclaimable:141532kB slab_unreclaimable:84840kB kernel_stack:1928kB pagetables:22400kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:0 all_unreclaimable? no
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564983] lowmem_reserve[]: 0 0 27559 27559
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.564995] HighMem free:776728kB min:512kB low:4636kB high:8760kB active_anon:1943840kB inactive_anon:482484kB active_file:163356kB inactive_file:185588kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:3527556kB mlocked:0kB dirty:1900kB writeback:60kB mapped:79756kB shmem:117796kB slab_reclaimable:0kB slab_unreclaimable:0kB kernel_stack:0kB pagetables:0kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:0 all_unreclaimable? no
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.565001] lowmem_reserve[]: 0 0 0 0
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.565011] DMA: 385*4kB 16*8kB 3*16kB 9*32kB 6*64kB 2*128kB 1*256kB 0*512kB 0*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 2900kB
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.565032] Normal: 21505*4kB 6508*8kB 273*16kB 24*32kB 3*64kB 0*128kB 0*256kB 0*512kB 0*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 143412kB
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.565054] HighMem: 949*4kB 8859*8kB 7063*16kB 6186*32kB 4631*64kB 727*128kB 6*256kB 0*512kB 0*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 776604kB
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.565076] 198980 total pagecache pages
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.565079] 14850 pages in swap cache
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.565082] Swap cache stats: add 2556273, delete 2541423, find 82961339/83153719
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.565085] Free swap  = 250592kB
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.565087] Total swap = 385520kB
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.575454] 1073152 pages RAM
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.575458] 888834 pages HighMem
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.575461] 11344 pages reserved
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.575463] 1090481 pages shared
Sep  4 10:16:59 uriel kernel: [32571790.575465] 737188 pages non-shared

Тепер я не знаю, що це означає. Є багато вільної пам’яті;

             total       used       free     shared    buffers     cached
Mem:       4247232    3455904     791328          0       5348     736412
-/+ buffers/cache:    2714144    1533088
Swap:       385520     131004     254516

Хоча зараз я бачу, що своп є порівняно низьким, але чи це має значення?

Я починав думати про фрагментацію або використання inode на цьому великому розділі, але останній показник fsck на ньому показав, як 0,5% фрагментації. Що залишає мене з використанням inode, але скільки ефекту насправді матиме велика таблиця inode або TOC файлової системи?

Я люблю чути думку людей з цього приводу. Це водить мене горщиком!

df -h вихід;

Filesystem            Size  Used Avail Use% Mounted on
/dev/xvda1            9.5G  6.6G  2.4G  74% /
tmpfs                 2.1G     0  2.1G   0% /lib/init/rw
udev                   10M  520K  9.5M   6% /dev
tmpfs                 2.1G     0  2.1G   0% /dev/shm
/dev/xvdb             980G  921G   59G  94% /data

вихід xfs_db;

# xfs_db -r -c frag /dev/xvdb
actual 15687263, ideal 15385050, fragmentation factor 1.93%

У цьому випадку файлова система XFS все ще може бути. У вас можуть виникнути важкі проблеми з фрагментацією, а також уповільнення, яке відбувається з майже повноцінною файловою системою. Ви можете виграти більше місця в будь-якому випадку.

Перевірте фрагментацію файлової системи XFS. Це можна зробити за допомогою xfs_dbкоманди. Якщо файлова система є /dev/sdb1, наприклад, тоді команда буде виглядати так:

xfs_db -r -c frag /dev/sdb1

Це виведе коефіцієнт фрагментації:

actual 66524, ideal 55966, fragmentation factor 15.87%

Ви можете запустити онлайн - утиліту дефрагментації xfs_fsr -v, в screenсесії , щоб спробувати виправити це. За замовчуванням команда працює протягом 2 годин або TEN проходить по файловій системі. Можливо, вам доведеться запустити його кілька разів. Перевірте коефіцієнт фрагментації між прогонами.

Файлові системи Unix не люблять бути повноцінними. Спробуйте виростити повільну файлову систему. Якщо це неможливо, спробуйте дефрагментувати його за допомогою xfs_fsr

Є два інструменти, за допомогою яких можна побачити, що відбувається на вашому сервері. IOSTAT і iotop , допоможе вам знайти проблему.

Якщо ви хочете отримати два пріоритети, які мають на вашому сервері різні процеси стосовно IO, ви можете використовувати ionice . Цього може бути достатньо, щоб виправити ваші проблеми, але це, ймовірно, тимчасове виправлення. Ви можете вивчити різні сховища чи ресурси для вашого сервера.

iostat
Iostat можна використовувати для визначення того, які пристрої зберігання / пам'яті сповільнюють ваш сервер. Він має деякі приємні статистичні дані. Як тільки ви дізнаєтесь, який пристрій сповільнює роботу, у вас може бути набагато краще уявлення про те, де зосередити свою увагу.

$ іостат
Linux 3.2.0-30-generic (aaron-laptop) 11.09.2012 _x86_64_ (4 процесора)

avg-cpu:% user% nice% system% iowait% украсти% простою
           5,83 0,07 3,00 1,81 0,00 89,29

Пристрій: tps kB_read / s kB_wrtn / s kB_read kB_wrtn
sda 20,64 231,97 76,26 1290702 424315

iotop Чудово
підходить для визначення того, який процес очікується найдовше, щоб закінчити IO, або є найбільш інтенсивним.

Всього ЧИТАТИ ДИСК: 0.00 B / s | Всього ПИСЬМО ДИСКУ: 9,89 К / с
  TID PRIO КОРИСТУВАЧ ДИСК ЧИТАЙТЕ ДИСК ЗАПИСЬ SWAPIN IO> COMMAND          
  349 be / 3 корінь 0,00 B / s 1012,49 B / s 0,00% 1,79% [jbd2 / sda3-8]
    1 be / 4 корінь 0,00 B / s 0,00 B / s 0,00% 0,00% init
    2 бути / 4 кореня 0,00 B / s 0,00 B / s 0,00% 0,00% [kthreadd]
    3 бути / 4 кореня 0,00 В / с 0,00 В / с 0,00% 0,00% [ksoftirqd / 0]

йоніс

 ionice - допомогти

ionice - встановлює або отримує клас і пріоритет планування процесу.

Використання:
  ionice [OPTION] -p PID [PID ...]
  ionice [ВАРІАНТ] КОМАНДА

Параметри:
  -c, --клас планування назви або номера класу
                           0: немає, 1: в режимі реального часу, 2: найкращі зусилля, 3: простої
  -n, --класифікація даних класу для планування
                           0-7 для занять у режимі реального часу та найкращих зусиль
  -p, --pid = PID переглянути або змінити вже запущений процес
  -t, - ігноруйте невдачі
  -V, - інформація про вихідну версію та вихід
  -h, - допоможе відобразити цю допомогу та вийти