Як працює нормалізація квантилів?


15

У дослідженнях експресії генів за допомогою мікроматеріалів дані про інтенсивність мають бути нормалізовані, щоб можна було порівнювати інтенсивність між індивідами, між генами. Концептуально та алгоритмічно, як працює «нормалізація кванті», і як би ви пояснили це нестатисту?


2
Просто: це "класифікація по кривій". :-) Я даю алгоритм на Quantdec.com/envstats/notes/class_03/probability.htm ("Читання графіків QQ").
whuber

Це PDF пояснює квантиль нормалізація з простим прикладом: працювала plexdb.org/modules/documentation/RMAexplained.pdf Папір , пояснює більший процес (RMA) , але квантиль нормалізація виконується в якості одного з етапів.
JHubbard80

Відповіді:


7

Порівняння методів нормалізації даних олігонуклеотидного масиву високої щільності на основі дисперсії та зміщення Bolstad et al. вводить кількісну нормалізацію даних масиву і порівнює їх з іншими методами. У ньому є досить чіткий опис алгоритму.

jF^1G^jG^jF^1G^jjF^

Зрештою, це метод перетворення всіх масивів на спільний розподіл інтенсивності.

Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.