Я стежу за курсом байєсівської статистики за допомогою BUGS та R. Тепер я вже знаю BUGS, це чудово, але я не дуже люблю використовувати окрему програму, а не просто R.
Я читав, що в Р. є багато нових пакетів Bayesian. Чи є список або посилання на те, які пакунки існують для статистики Bayesian і що вони роблять? І чи існує альтернатива пакету R для гнучкості BUGS?
Відповіді:
Ви можете подивитися на пакет MCMCglmm, який постачається з дуже приємними віньєтками. Там є також bayesglm()функція для установки байєсівської узагальнених лінійних моделей в руці пакет, Ендрю Гельман. Я також чув про майбутній випуск blmer / bglmerфункції для ієрархічного моделювання в одному пакеті.
Кілька людей, яких я знаю, використовували JAGS . Синтаксис JAGS схожий на BUGS.
Продуктивність є основною причиною, коли люди використовують WinBUGS / OpenBUGS / JAGS проти таких пакетів, як MCMglmm. Це дуже важко не практично , щоб написати ефективний Гіббс семплер в рідному R. Є пакети , які дозволяють запускати моделі помилок з R сценарію, в зокрема RBUGS і BUGSParallel .
MCMCglammє поганим прикладом, тому що "[a] ll моделювання виконується в C / C ++ за допомогою бібліотеки CSparse для рідких лінійних систем" (див. реферат ).