Яке розподіл передбачає точний тест Фішера?


11

У своїй роботі я бачив кілька застосувань точного тесту Фішера, і мені було цікаво, наскільки він добре відповідає моїм даним. Дивлячись на кілька джерел, я розумів, як обчислити статистику, але ніколи не бачив чіткого та формального пояснення припущеної нульової гіпотези.

Чи може мені хтось пояснити чи направити мені офіційне пояснення передбачуваного розподілу? Будемо вдячні за пояснення з точки зору значень у таблиці надзвичайних ситуацій.


3
У випадку 2х2 він заснований на гіпергеометричному розподілі.
Glen_b -Встановіть Моніку

Відповіді:


11

2×2X1Bin(n1,θ1)X2Bin(n2,θ2)θ1=θ2X1X1+X2ψ=θ11θ1θ21θ2ψ=1

Цей розподіл має свою сторінку у Вікіпедії .

Щоб оцінити його за допомогою R, ви можете просто використовувати формулу, що визначає умовну ймовірність:

p1 <- 7/27
p2 <- 14/70
x1 <- 7; n1 <- 27
x2 <- 14; n2 <- 56
# 
m <- x1+x2
dbinom(x1, n1, p1)*dbinom(x2, n2, p2)/sum(dbinom(0:m, n1, p1)*dbinom(m-(0:m), n2, p2))
[1] 0.1818838

Або скористайтеся dnoncenhypergeomфункцією MCMCpackпакета:

psi <- p1/(1-p1)/(p2/(1-p2)) # this is the odds ratio
MCMCpack::dnoncenhypergeom(x=x1, n1, n2, x1+x2, psi)
[1] 0.1818838

Дякую @Stephane Чи можете ви пояснити далі, чому він стає гіпергеометричним і які параметри?
Аміт Лавон

2
Вибачте @AmitLavon, я не знаю деталей цього гіпергеометричного розподілу.
Стефан Лоран

1
@AmitLavon Я щойно відредагував свою відповідь, щоб включити посилання на wikipedia та R-код.
Стефан Лоран

10

χ2

  • Дві змінні, що оцінюються на асоціацію, є справді багатотомними змінними, що не мають нічого, наприклад мертві / живі США / Європа. Якщо одна чи обидві змінні є спрощенням базового континууму, категоричний аналіз даних взагалі не повинен проводитися.
  • YXYY=yXxYX2×2Тест на таблицю на контекст передбачає, що кожен суб'єкт, який лікує А, має однакову ймовірність смерті. [Можна стверджувати, що це занадто суворе припущення, але ця позиція не визнає втрати влади на те, щоб зробити невідрегульовані тести на асоціацію.]

χ2XYYPPχ2 P


Дякую @FrankHarrell Чи можете ви навести посилання на те, що ваше твердження про чі-квадратні P-значення є більш точними, ніж у Фішера?
Аміт Лавон

1
Див., Наприклад, citeulike.org/user/harrelfe/tag/fishers-exact-test . Це обговорювалося на стадії обміну.
Френк Харрелл

на жаль, ctiteulike вже немає, а web.archive.org лише, схоже, перескакував першу сторінку акаунта гаррельфа.
Glen_b -Встановити Моніку

Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.