При моделюванні безперервних пропорцій (наприклад, пропорційне рослинне покриття на квадратах обстеження або частка часу, що займається діяльністю) логістичний регрес вважається недоцільним (наприклад, Warton & Hui (2011 ). Швидше, регресія OLS після перетворення пропорцій logit, або, можливо, бета-регресія, є більш підходящими.
За яких умов оцінки коефіцієнтів логічно-лінійної регресії та логістичної регресії різняться при використанні R lm
та glm
?
Візьмемо наступний модельований набір даних, де можна припустити, що p
це наші необроблені дані (тобто безперервні пропорції, а не представлення ):
set.seed(1)
x <- rnorm(1000)
a <- runif(1)
b <- runif(1)
logit.p <- a + b*x + rnorm(1000, 0, 0.2)
p <- plogis(logit.p)
plot(p ~ x, ylim=c(0, 1))
Встановлюючи лінійно-лінійну модель, отримуємо:
summary(lm(logit.p ~ x))
##
## Call:
## lm(formula = logit.p ~ x)
##
## Residuals:
## Min 1Q Median 3Q Max
## -0.64702 -0.13747 -0.00345 0.15077 0.73148
##
## Coefficients:
## Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
## (Intercept) 0.868148 0.006579 131.9 <2e-16 ***
## x 0.967129 0.006360 152.1 <2e-16 ***
## ---
## Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
##
## Residual standard error: 0.208 on 998 degrees of freedom
## Multiple R-squared: 0.9586, Adjusted R-squared: 0.9586
## F-statistic: 2.312e+04 on 1 and 998 DF, p-value: < 2.2e-16
Логістична регресія дає:
summary(glm(p ~ x, family=binomial))
##
## Call:
## glm(formula = p ~ x, family = binomial)
##
## Deviance Residuals:
## Min 1Q Median 3Q Max
## -0.32099 -0.05475 0.00066 0.05948 0.36307
##
## Coefficients:
## Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)
## (Intercept) 0.86242 0.07684 11.22 <2e-16 ***
## x 0.96128 0.08395 11.45 <2e-16 ***
## ---
## Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
##
## (Dispersion parameter for binomial family taken to be 1)
##
## Null deviance: 176.1082 on 999 degrees of freedom
## Residual deviance: 7.9899 on 998 degrees of freedom
## AIC: 701.71
##
## Number of Fisher Scoring iterations: 5
##
## Warning message:
## In eval(expr, envir, enclos) : non-integer #successes in a binomial glm!
Чи завжди оцінки коефіцієнта логістичної регресії будуть неупередженими щодо оцінок логічно-лінійної моделі?
family=binomial
випливає, що залежна змінна являє собою біноміальне число, а не пропорції. І як би glm
знати, що 0.1
це як "один із десяти", а не "десять із сотні"? Хоча сама пропорція не відрізняється, це має великі наслідки для обчислення стандартної помилки.
weights
аргументу вектор, що містить кількість випробувань (хоча це не те, що я намагався у своєму дописі, де я навмисно аналізував дані неправильно).
0.1
там «було», скажімо, 10 незалежних випробувань, що дають один успіх. Для лінійної моделі -0.1
це просто значення, якась довільна міра.