Різниця між ElasticNet у науковому навчальному Python та Glmnet в R


11

Хто-небудь намагався перевірити, чи встановлення моделі Elastic Net з ElasticNetнауками на Python та glmnetR в одному наборі даних дає однакові арифметичні результати? Я експериментував з багатьма комбінаціями параметрів (оскільки дві функції відрізняються за значеннями за замовчуванням, які вони передають аргументам), а також масштабування даних, але ніби нічого не створює однакову модель між двома мовами. Хтось стикався з тим же питанням?


Відповіді:


6

Нарешті я отримав однакові значення із наступним кодом:

Пітон

# normalize function that gives the same with R
def mystandardize(D):
   S = np.std(D, axis=0, ddof=1)
   M = np.mean(D, axis = 0)
   D_norm = (D-M)/S
return [D_norm, M, S]

Y_norm_train = pd.DataFrame(mystandardize(Y_train)[0])
glmnet_regr = linear_model.ElasticNet(alpha=1, l1_ratio = 0.01,
                                  fit_intercept = True, normalize =    False, tol=0.0000001, max_iter = 100000)
glmnet_regr.fit(X_train, Y_norm_train)

R

y_norm_train <- scale(y[train_idx])
glmnet_obj_norm <- glmnet(x_train, y_norm_train, alpha=0.01, lambda = 1,  
                   thresh = 1e-07, standardize = FALSE, intercept=TRUE, standardize.response = FALSE)
print_coef(glmnet_obj_norm)

3
Існує відносно новий пітон обгортка для Fortran коду , використовуваного в R пакеті glmnet. Це повинно також отримати вам ті ж результати , як і в R . github.com/civisanalytics/python-glmnet
Жорді
Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.