Запитання в одному реченні: Хтось знає, як визначити хороші ваги класів для випадкового лісу?
Пояснення: Я граю з незбалансованими наборами даних. Я хочу використовувати R
пакет randomForest
для того, щоб навчити модель на дуже перекошеному наборі даних з лише невеликими позитивними прикладами та багатьма негативними прикладами. Я знаю, є й інші методи, і врешті-решт я їх використаю, але з технічних причин побудова випадкового лісу є проміжним кроком. Тому я розігрувався з параметром classwt
. Я встановлюю дуже штучний набір даних з 5000 негативних прикладів на диску з радіусом 2, а потім я вибираю 100 позитивних прикладів на диску з радіусом 1. Я підозрюю, що
1) без зважування класу модель стає "виродженою", тобто прогнозує FALSE
всюди.
2) при справедливому зважуванні класу я побачу "зелену крапку" посередині, тобто він передбачить диск із радіусом 1 так, як TRUE
хоча є й негативні приклади.
Ось як виглядають дані:
Це те , що відбувається без зважування: (дзвінок: randomForest(x = train[, .(x,y)],y = as.factor(train$z),ntree = 50)
)
Для перевірки я також спробував, що трапляється, коли я жорстоко врівноважую набір даних, знижуючи дискретизацію негативного класу, щоб співвідношення було знову 1: 1. Це дає мені очікуваний результат:
Однак, коли я обчислюю модель із зважуванням класу 'FALSE' = 1, 'TRUE' = 50 (це справедливе зважування, оскільки в 50 разів більше негативів, ніж позитивних), я отримую це:
Тільки коли я встановлюю ваги на якесь дивне значення, наприклад "FALSE" = 0,05 і "TRUE" = 500000, я отримую розумні результати:
І це досить нестабільно, тобто зміна ваги 'FALSE' до 0,01 змушує модель знову вироджуватися (тобто вона передбачає TRUE
всюди).
Питання: Хтось знає, як визначити хороші ваги класів для випадкового лісу?
R код:
library(plot3D)
library(data.table)
library(randomForest)
set.seed(1234)
amountPos = 100
amountNeg = 5000
# positives
r = runif(amountPos, 0, 1)
phi = runif(amountPos, 0, 2*pi)
x = r*cos(phi)
y = r*sin(phi)
z = rep(T, length(x))
pos = data.table(x = x, y = y, z = z)
# negatives
r = runif(amountNeg, 0, 2)
phi = runif(amountNeg, 0, 2*pi)
x = r*cos(phi)
y = r*sin(phi)
z = rep(F, length(x))
neg = data.table(x = x, y = y, z = z)
train = rbind(pos, neg)
# draw train set, verify that everything looks ok
plot(train[z == F]$x, train[z == F]$y, col="red")
points(train[z == T]$x, train[z == T]$y, col="green")
# looks ok to me :-)
Color.interpolateColor = function(fromColor, toColor, amountColors = 50) {
from_rgb = col2rgb(fromColor)
to_rgb = col2rgb(toColor)
from_r = from_rgb[1,1]
from_g = from_rgb[2,1]
from_b = from_rgb[3,1]
to_r = to_rgb[1,1]
to_g = to_rgb[2,1]
to_b = to_rgb[3,1]
r = seq(from_r, to_r, length.out = amountColors)
g = seq(from_g, to_g, length.out = amountColors)
b = seq(from_b, to_b, length.out = amountColors)
return(rgb(r, g, b, maxColorValue = 255))
}
DataTable.crossJoin = function(X,Y) {
stopifnot(is.data.table(X),is.data.table(Y))
k = NULL
X = X[, c(k=1, .SD)]
setkey(X, k)
Y = Y[, c(k=1, .SD)]
setkey(Y, k)
res = Y[X, allow.cartesian=TRUE][, k := NULL]
X = X[, k := NULL]
Y = Y[, k := NULL]
return(res)
}
drawPredictionAreaSimple = function(model) {
widthOfSquares = 0.1
from = -2
to = 2
xTable = data.table(x = seq(from=from+widthOfSquares/2,to=to-widthOfSquares/2,by = widthOfSquares))
yTable = data.table(y = seq(from=from+widthOfSquares/2,to=to-widthOfSquares/2,by = widthOfSquares))
predictionTable = DataTable.crossJoin(xTable, yTable)
pred = predict(model, predictionTable)
res = rep(NA, length(pred))
res[pred == "FALSE"] = 0
res[pred == "TRUE"] = 1
pred = res
predictionTable = predictionTable[, PREDICTION := pred]
#predictionTable = predictionTable[y == -1 & x == -1, PREDICTION := 0.99]
col = Color.interpolateColor("red", "green")
input = matrix(c(predictionTable$x, predictionTable$y), nrow = 2, byrow = T)
m = daply(predictionTable, .(x, y), function(x) x$PREDICTION)
image2D(z = m, x = sort(unique(predictionTable$x)), y = sort(unique(predictionTable$y)), col = col, zlim = c(0,1))
}
rfModel = randomForest(x = train[, .(x,y)],y = as.factor(train$z),ntree = 50)
rfModelBalanced = randomForest(x = train[, .(x,y)],y = as.factor(train$z),ntree = 50, classwt = c("FALSE" = 1, "TRUE" = 50))
rfModelBalancedWeird = randomForest(x = train[, .(x,y)],y = as.factor(train$z),ntree = 50, classwt = c("FALSE" = 0.05, "TRUE" = 500000))
drawPredictionAreaSimple(rfModel)
title("unbalanced")
drawPredictionAreaSimple(rfModelBalanced)
title("balanced with weights")
pos = train[z == T]
neg = train[z == F]
neg = neg[sample.int(neg[, .N], size = 100, replace = FALSE)]
trainSampled = rbind(pos, neg)
rfModelBalancedSampling = randomForest(x = trainSampled[, .(x,y)],y = as.factor(trainSampled$z),ntree = 50)
drawPredictionAreaSimple(rfModelBalancedSampling)
title("balanced with sampling")
drawPredictionAreaSimple(rfModelBalancedWeird)
title("balanced with weird weights")