Як використовувати R gbm з розподілом = "adaboost"?


9

Документація стверджує, що R gbm з розподілом = "adaboost" може використовуватися для задачі класифікації 0-1. Розглянемо наступний фрагмент коду:

gbm_algorithm <- gbm(y ~ ., data = train_dataset, distribution = "adaboost", n.trees = 5000)
gbm_predicted <- predict(gbm_algorithm, test_dataset, n.trees = 5000)

Її можна знайти в документації, яка передбачає.gbm

Повертає вектор прогнозів. За замовчуванням прогнози знаходяться у шкалі f (x).

Однак конкретна шкала не є зрозумілою для випадку розподілу = "adaboost".

Чи може хтось допомогти з інтерпретацією повернених значень predict.gbm і дати уявлення про перетворення на вихід 0-1?


Це питання, мабуть, стосується лише того, як інтерпретувати вихід R, а не щодо пов'язаних із цим статистичних питань (хоча це не робить це поганим Q). Як таке, краще запитати, і, мабуть, відповісти, на Stack Overflow , а не тут. Будь ласка, не перехресне повідомлення (SE сильно заважає цьому), якщо ви хочете, щоб ваш Q мігрував швидше, будь ласка, позначте його для уваги модератора.
gung - Відновіть Моніку

4
@gung здається мені законним статистичним питанням. Пакет GBM постачає Deviance, що використовується для adaboost, але мені не ясно, що таке f (x), і як повернути перетворення до шкали ймовірностей (можливо, треба використовувати масштаб Платта). cran.r-project.org/web/packages/gbm/vignettes/gbm.pdf
B_Miner

Відповіді:


11

Метод adaboost дає прогнози за шкалою logit. Ви можете перетворити його на вихід 0-1:

gbm_predicted<-plogis(2*gbm_predicted)

зверніть увагу на 2 * всередині логіса


11

Ви також можете безпосередньо отримати ймовірності з predict.gbmфункції;

predict(gbm_algorithm, test_dataset, n.trees = 5000, type = 'response')

3

Функція AdaBoost посилання описана тут . Цей приклад надає детальний опис обчислення:

library(gbm);
set.seed(123);
n          <- 1000;
sim.df     <- data.frame(x.1 = sample(0:1, n, replace=TRUE), 
                         x.2 = sample(0:1, n,    replace=TRUE));
prob.array <- c(0.9, 0.7, 0.2, 0.8);
df$y       <- rbinom(n, size = 1, prob=prob.array[1+sim.df$x.1+2*sim.df$x.2])
n.trees    <- 10;
shrinkage  <- 0.01;

gbmFit <- gbm(
  formula           = y~.,
  distribution      = "bernoulli",
  data              = sim.df,
  n.trees           = n.trees,
  interaction.depth = 2,
  n.minobsinnode    = 2,
  shrinkage         = shrinkage,
  bag.fraction      = 0.5,
  cv.folds          = 0,
  # verbose         = FALSE
  n.cores           = 1
);

sim.df$logods  <- predict(gbmFit, sim.df, n.trees = n.trees);  #$
sim.df$prob    <- predict(gbmFit, sim.df, n.trees = n.trees, type = 'response');  #$
sim.df$prob.2  <- plogis(predict(gbmFit, sim.df, n.trees = n.trees));  #$
sim.df$logloss <- sim.df$y*log(sim.df$prob) + (1-sim.df$y)*log(1-sim.df$prob);  #$


gbmFit <- gbm(
  formula           = y~.,
  distribution      = "adaboost",
  data              = sim.df,
  n.trees           = n.trees,
  interaction.depth = 2,
  n.minobsinnode    = 2,
  shrinkage         = shrinkage,
  bag.fraction      = 0.5,
  cv.folds          = 0,
  # verbose         = FALSE
  n.cores           = 1
);

sim.df$exp.scale  <- predict(gbmFit, sim.df, n.trees = n.trees);  #$
sim.df$ada.resp   <- predict(gbmFit, sim.df, n.trees = n.trees, type = 'response');  #$
sim.df$ada.resp.2 <- plogis(2*predict(gbmFit, sim.df, n.trees = n.trees));  #$
sim.df$ada.error  <- -exp(-sim.df$y * sim.df$exp.scale);  #$

sim.df[1:20,]

Я не можу редагувати, оскільки я міняю занадто мало. „PDF y´. y´shouldbe´sim.df
Рік
Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.