Зараз я використовую пакет Rme lme4 .
Я використовую лінійні моделі змішаних ефектів із випадковими ефектами:
library(lme4)
mod1 <- lmer(r1 ~ (1 | site), data = sample_set) #Only random effects
mod2 <- lmer(r1 ~ p1 + (1 | site), data = sample_set) #One fixed effect +
# random effects
mod3 <- lmer(r1 ~ p1 + p2 + (1 | site), data = sample_set) #Two fixed effects +
# random effects
Для порівняння моделей я використовую anova
функцію та розглядаю відмінності AIC щодо найнижчої моделі AIC:
anova(mod1, mod2, mod3)
Сказане вище чудово для порівняння моделей.
Однак мені також потрібен простий спосіб інтерпретувати корисність відповідних заходів для кожної моделі. Хтось має досвід таких заходів? Я провів декілька досліджень, і є журнальні статті на R у квадраті для фіксованих ефектів змішаних ефектів:
- Cheng, J., Edwards, LJ, Maldonado-Molina, MM, Komro, KA, & Muller, KE (2010). Справжній поздовжній аналіз даних для реальних людей: Створення досить хорошої змішаної моделі. Статистика в медицині, 29 (4), 504-520. doi: 10.1002 / sim.3775
- Edwards, LJ, Muller, KE, Wolfinger, RD, Qaqish, BF, & Schabenberger, O. (2008). Статистика R2 для фіксованих ефектів у лінійній змішаній моделі. Статистика в медицині, 27 (29), 6137-6157. doi: 10.1002 / sim.3429
Однак видається, що є певна критика щодо використання таких заходів, як запропоновані у вищезазначених документах.
Чи не може хтось запропонувати кілька простих для тлумачення, корисність відповідних заходів, які можуть застосовуватися до моїх моделей?
mixed()
в моєму пакеті afex ( версія для розробки також має параметричний завантажувальний пристрій ). Дивіться тут декілька посилань .
KRmodcomp
з пакету pbkrtest
. Ви також можете використовувати KRmodcomp
безпосередньо для порівняння моделей.