Як я можу взяти вибірку з розподілу суміші, зокрема суміші звичайних розподілів R? Наприклад, якщо я хотів зробити вибірку з:
як я міг це зробити?
Як я можу взяти вибірку з розподілу суміші, зокрема суміші звичайних розподілів R? Наприклад, якщо я хотів зробити вибірку з:
як я міг це зробити?
Відповіді:
Доцільно уникати forциклів Rз міркувань продуктивності. Альтернативне рішення, яке використовує факт, rnormє векторизованим:
N <- 100000
components <- sample(1:3,prob=c(0.3,0.5,0.2),size=N,replace=TRUE)
mus <- c(0,10,3)
sds <- sqrt(c(1,1,0.1))
samples <- rnorm(n=N,mean=mus[components],sd=sds[components])
samples <- rnorm(N)*sds[components]+mus[components]. Мені легше читати :)
Загалом, одним із найпростіших способів вибірки з розподілу суміші є наступний:
Кроки алгоритму
1) Створити випадкову змінну
2) Якщо інтервал, де p k відповідає ймовірності k t h компонента моделі суміші, то генеруємо з розподіл k t h компонента
3) Повторюйте кроки 1) та 2), поки у вас не з’явиться потрібна кількість зразків з розподілу суміші
Тепер, використовуючи загальний алгоритм, наведений вище, ви можете взяти вибірку із прикладу суміші нормалів, використовуючи наступний Rкод:
#The number of samples from the mixture distribution
N = 100000
#Sample N random uniforms U
U =runif(N)
#Variable to store the samples from the mixture distribution
rand.samples = rep(NA,N)
#Sampling from the mixture
for(i in 1:N){
if(U[i]<.3){
rand.samples[i] = rnorm(1,0,1)
}else if(U[i]<.8){
rand.samples[i] = rnorm(1,10,1)
}else{
rand.samples[i] = rnorm(1,3,.1)
}
}
#Density plot of the random samples
plot(density(rand.samples),main="Density Estimate of the Mixture Model")
#Plotting the true density as a sanity check
x = seq(-20,20,.1)
truth = .3*dnorm(x,0,1) + .5*dnorm(x,10,1) + .2*dnorm(x,3,.1)
plot(density(rand.samples),main="Density Estimate of the Mixture Model",ylim=c(0,.2),lwd=2)
lines(x,truth,col="red",lwd=2)
legend("topleft",c("True Density","Estimated Density"),col=c("red","black"),lwd=2)
Що породжує:

і як перевірка здорового стану:

Концептуально ви вибираєте лише один розподіл (від можливості) з деякою ймовірністю, а потім генерувати псевдовипадкові змінні з цього розподілу. В R, це буде (наприклад):
set.seed(8) # this makes the example reproducible
N = 1000 # this is how many data you want
probs = c(.3,.8) # these are *cumulative* probabilities; since they
# necessarily sum to 1, the last would be redundant
dists = runif(N) # here I'm generating random variates from a uniform
# to select the relevant distribution
# this is where the actual data are generated, it's just some if->then
# statements, followed by the normal distributions you were interested in
data = vector(length=N)
for(i in 1:N){
if(dists[i]<probs[1]){
data[i] = rnorm(1, mean=0, sd=1)
} else if(dists[i]<probs[2]){
data[i] = rnorm(1, mean=10, sd=1)
} else {
data[i] = rnorm(1, mean=3, sd=.1)
}
}
# here are a couple of ways of looking at the results
summary(data)
# Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max.
# -3.2820 0.8443 3.1910 5.5350 10.0700 13.1600
plot(density(data))

ifelse()заяві, але мені доведеться це з'ясувати пізніше. Я замінив цей код без циклу.
Rфокус програмування: ви також можете використовувати findInterval()іcumsum() команди команди для спрощення коду і, що ще важливіше, полегшити узагальнення до різної кількості вимірів. Наприклад, для вхідного вектора засобів( mu) та дисперсії( s) та ймовірності суміші ( p), простою функцією для генерування n зразків з цієї суміші будеmix <- function(n,mu,s,p) { ii <- findInterval(runif(n),cumsum(p))+1; x <- rnorm(n,mean=mu[ii],sd=sqrt(s[ii])); return(x); }
findInterval()команди, однак мені подобається писати код настільки спрощено, наскільки я можу, бо хочу, щоб це був інструмент для розуміння, а не ефективності.
Вже дано ідеальні відповіді, тому для тих, хто хоче досягти цього в Python, ось моє рішення:
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline
mu = [0, 10, 3]
sigma = [1, 1, 1]
p_i = [0.3, 0.5, 0.2]
n = 10000
x = []
for i in range(n):
z_i = np.argmax(np.random.multinomial(1, p_i))
x_i = np.random.normal(mu[z_i], sigma[z_i])
x.append(x_i)
def univariate_normal(x, mean, variance):
"""pdf of the univariate normal distribution."""
return ((1. / np.sqrt(2 * np.pi * variance)) *
np.exp(-(x - mean)**2 / (2 * variance)))
a = np.arange(-7, 18, 0.01)
y = p_i[0] * univariate_normal(a, mean=mu[0], variance=sigma[0]**2) + p_i[1] * univariate_normal(a, mean=mu[1], variance=sigma[0]**2)+ p_i[2] * univariate_normal(a, mean=mu[2], variance=sigma[0]**2)
fig, ax = plt.subplots(figsize=(8, 4))
ax.hist(x, bins=100, density=True)
ax.plot(a, y)