Дуже гарна стаття, що пояснює загальний підхід ЛММ та їх перевагу перед ANOVA:
Лінійні моделі змішаних ефектів (LMM) узагальнюють регресійні моделі, щоб вони мали залишкові компоненти, випадкові ефекти, на рівні, наприклад, людей або предметів, а не лише на рівні окремих спостережень. Моделі дуже гнучкі, наприклад, дозволяють моделювати різні нахили та перехоплення.
LMM працюють, використовуючи якусь функцію правдоподібності, вірогідність передачі вашим даним певного параметра та метод для максимізації цього (Максимальне оцінювання ймовірності; MLE), обмінюючись з параметрами. MLE - це дуже загальна методика, яка дозволяє безліч різних моделей, наприклад, для двійкових і лічильних даних, підходити до даних, і пояснюється в ряді місць, наприклад,
- Агресті, А. (2007). Вступ до категоричного аналізу даних (2-е видання) . Джон Вілі та сини.
LMM, однак, не можуть мати справу з не-гауссовими даними, як двійкові дані чи рахунки; для цього вам потрібні узагальнені лінійні моделі змішаних ефектів (GLMM). Один із способів зрозуміти це - спершу заглянути в ГЛМ; див. також Agresti (2007).