Ваша проблема була роз'яснена на програмній вікі
Налаштування
Sysadmins може налаштувати речі, редагуючи /etc/xdg/user-dirs.conf. Наразі є лише два налаштування, ви можете відключити всю справу, і ви можете вказати кодування шаблонів, що використовується для імен файлів. Вони також можуть встановлювати або змінювати каталоги за замовчуванням та їх початкові значення в /etc/xdg/user-dirs.defaults.
$ (XDG_CONFIG_HOME) /user-dirs.dirs вказує поточний набір каталогів для користувача. Цей файл у форматі оболонки, тому його легко отримати зі скрипта оболонки. Цей файл також може бути модифікований користувачами (вручну або через програми), щоб змінити використовувані каталоги. Примітка. Щоб відключити каталог, наведіть його на homedir. Якщо ви видалите його, він буде відтворений під час наступного входу.
Таким чином, ваш ~/.config/user-dirs.dirs
може бути змінений як
XDG_DOWNLOAD_DIR="$HOME"
XDG_TEMPLATES_DIR="$HOME"
XDG_PUBLICSHARE_DIR="$HOME"
XDG_DOCUMENTS_DIR="$HOME"
XDG_MUSIC_DIR="$HOME"
XDG_PICTURES_DIR="$HOME"
XDG_VIDEOS_DIR="$HOME"