Якщо ви не зацікавлені в створенні RAID, я б запропонував розглянути можливість підключення одного диска до Intel SATA3, а іншого - до порту GSATA.
Оскільки основна (лише?) Різниця між SATA та "GSATA" полягає в тому, що "GSATA" використовує окремий бортовий контролер (Marvell; окремо від чіпсета Intel).
Ось чому я пропоную використовувати один з кожного, оскільки він дасть кожному диску, власний контролер, шлях даних тощо.
З іншого боку, вимкнення одного з контролерів (тобто GSATA) може звільнити достатню кількість ресурсів, що наявність обох приводів на одному контролері може бути "швидшою" опцією.
Особисто я б відключив Marvell і просто поїхав би з Intel для обох дисків, на одного менш драйвера, про який потрібно дбати.