проблема з встановленням RODBC в Ubuntu

У мене проблема з деякими відсутніми заголовками при спробі встановити RODBC в R на моєму Linux. Хтось може мені допомогти у цьому питанні?

> install.packages("RODBC")

Installing package(s) into ‘/home/administrator/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12’
(as ‘lib’ is unspecified)

trying URL 'http://cran.cnr.Berkeley.edu/src/contrib/RODBC_1.3-2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1108358 bytes (1.1 Mb)

opened URL
==================================================
downloaded 1.1 Mb

* installing *source* package ‘RODBC’ ...
checking for gcc... gcc
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables... 
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc accepts -g... yes
checking for gcc option to accept ANSI C... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -E
checking for egrep... grep -E
checking for ANSI C header files... yes
checking for sys/types.h... yes
checking for sys/stat.h... yes
checking for stdlib.h... yes
checking for string.h... yes
checking for memory.h... yes
checking for strings.h... yes
checking for inttypes.h... yes
checking for stdint.h... yes
checking for unistd.h... yes
checking sql.h usability... no
checking sql.h presence... no
checking for sql.h... no
checking sqlext.h usability... no
checking sqlext.h presence... no
checking for sqlext.h... no
configure: error: "ODBC headers sql.h and sqlext.h not found"
ERROR: configuration failed for package ‘RODBC’
* removing ‘/home/administrator/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12/RODBC’
Warning in install.packages :
  installation of package 'RODBC' had non-zero exit status

The downloaded packages are in
    ‘/tmp/RtmpqfNYpD/downloaded_packages’

Як зазначив Дірк у коментарях, якщо ви вже встановили r-cran-rodbc, не потрібно запускати install.packages () зсередини Р. "пакунок (RODBC)" повинен завантажувати пакет.

Загалом, коли ви бачите помилки щодо заголовків, це тому, що необхідна бібліотека розробок не встановлена. Рішення полягає в пошуку в Інтернеті, використовуючи імена файлів, які відсутні у заголовку ( наприклад, Google для "sqlext.h ubuntu"), щоб визначити необхідний пакет. У цьому випадку вам потрібен libiodbc2-dev. Так:

sudo apt-get install libiodbc2-dev

Тоді встановлення в межах R повинно працювати.

Вам справді потрібно будувати з джерела? Чому ви не використовуєте двійковий пакет?

Тож, можливо, спробуйте це замість цього:

  sudo apt-get install r-cran-rodbc

або використовувати будь-який фронтальний інтерфейс GUI до системи управління пакетами.

Після спроби встановити пакунки з усіх рішень на цьому веб-сайті та інших, я досяг успіху в створенні RODBCпакета, використовуючи:

sudo apt-get install unixodbc unixodbc-dev

Я також встановив:

• libiodbc2-dev
• libmyodbc
• odbc-postgresql

FWIW, у мене була така ж проблема ("ODBC заголовки sql.h і sqlext.h не знайдено") на OS X, і виправили її, встановивши unixodbc ( brew install unixodbc)

RODBC залежить від R (> = 3.0.0 (див., Наприклад, https://cran.r-project.org/web/packages/RODBC/RODBC.pdf )

Ваша локальна бібліотека пакунків ...

Installing package(s) into '/home/administrator/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12'

... говорить про те, що у вас може бути встановлена ​​старіша версія R (2.12). Якщо це так, спробуйте перейти на останню версію R.

У мене теж була ця проблема. Для мене рішення було те, що мені не вистачало деяких залежностей від Ubuntu, таких як

• unixodbc (> = 2.2.11)
• libmyodbc
• odbc-postgresql

Варто відзначити , що install.packages("RODBC", dependencies=TRUE)це НЕ забрати ці пакети. Вони лежать поза Rсобою.