Мало речей. Оскільки на одному з цих двох ваш vimrc "працює", це означає, що проблема в іншому (я припускаю, що на першому, все працює задовільно).
Vim може завантажувати конфігураційні файли з різних каталогів, які мають різні пріоритети завантаження (один замінює інший). Див. ": Допомогти vimfiles", щоб побачити, які з них є.
По-друге, спробуйте ": echo $ myvimrc", щоб побачити, звідки завантажується ваш "останній" vimrc. Це той, з яким ви зараз посилаєтесь?
По-третє, як Дейв уже вказував, чи є у вашому каталозі vim файл, який називається "filetype.vim", і чи є у вас адекватний файл файлового типу?
Якщо жодне з цих не допоможе вам, також повідомте нам, яку версію vim / gvim ви використовуєте