Відповіді:
У налаштуваннях TortoiseSVN у розділі Накладки значків встановіть для кешу статусу значення оболонки або "Нічого". Діалогове вікно виглядає приблизно так:
Хороша дискусія тут .
Також ви можете відключити його запуск на USB-накопичувачах, тому ви все одно отримаєте переваги роботи на основних дисках.