Єдина справді велика різниця між тим, як встановлювати речі з Software Center або іншого gui та робити це з командного рядка, це коли справи йдуть не так.
У більшості випадків повідомлення про помилки установки приховані, і вони просто дають вам загальне повідомлення про те, що воно не спрацювало. Коли ви робите це з командного рядка, ви бачите всі створені повідомлення. Часто цю інформацію можна використовувати для усунення проблеми, або вона скаже вам, чому ви, ймовірно, не хочете її виправити. Наприклад, встановлення пакета може порушити або видалити інші пакети, які вже встановлені.
Іноді пакет не вдається встановити лише тому, що одна з його залежностей не встановлена (а звичайна установка не виправляє автоматично так, як це робить більшість). Коли це трапляється, часто ви можете спочатку просто встановити відсутні пакет, і тоді ваша установка буде успішною.
Крім того, apt-get поінформує вас про інші пов'язані пакети, які "рекомендується" разом із вашим пакетом, тож ви можете переглянути їх і побачити, чи хочете ви будь-який з них.
Він також повідомляє про будь-які встановлені раніше пакети, які, ймовірно, більше не потрібні, і розповідає, як їх видалити.
Не слід додавати / видаляти пакети ні в одному з цих двох останніх кроків, не ретельно переглядаючи залучені пакети, але зазвичай це безпечно.
В Ubuntu 12.04 щойно встановлені додатки за замовчуванням додаються до запуску, але це відбувається лише для програм, встановлених за допомогою Центру програмного забезпечення.