Після встановлення бібліотеки geos (C ++ і C), а потім намагається встановити пакет rgeos (R), він повідомляє про відсутність конфігурації geos!


9

Знаючи, що пакет rgeos, з мови R, вимагає попередньої установки бібліотек geos, я встановив, обидва, libgeos і libgeos-c1 (3.2.2), використовуючи синаптичний інсталятор у моїй машині Ubuntu 12.04 (32 біт).

Потім я спробував встановити rgeos безпосередньо з консолі R, і він видав повідомлення в тому сенсі, що geos-config не знайдено. Вихід такий:

> install.packages("rgeos")
Installing package(s) into ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15’
(as ‘lib’ is unspecified)
also installing the dependency ‘sp’

probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/sp_1.0-9.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 882102 bytes (861 Kb)
URL abierta
==================================================
downloaded 861 Kb

probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/rgeos_0.2-19.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 221471 bytes (216 Kb)
URL abierta
==================================================
downloaded 216 Kb

* installing *source* package ‘sp’ ...
** package ‘sp’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c R    centroid.c -o Rcentroid.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c gcdist.c -o gcdist.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c init.c -o init.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c pip.c -o pip.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c pip2.c -o pip2.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c sp_xports.c -o sp_xports.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c surfaceArea.c -o surfaceArea.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c zerodist.c -o zerodist.o
gcc -std=gnu99 -shared -o sp.so Rcentroid.o gcdist.o init.o pip.o pip2.o sp_xports.o surfaceArea.o zerodist.o -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15/sp/libs
** R
** data
** demo
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
   ‘intro_sp.Rnw’ 
   ‘over.Rnw’ 
** testing if installed package can be loaded

* DONE (sp)
* installing *source* package ‘rgeos’ ...
** package ‘rgeos’ successfully unpacked and MD5 sums checked
configure: CC: gcc -std=gnu99
configure: CXX: g++
configure: rgeos: 0.2-17
checking for /usr/bin/svnversion... no
configure: svn revision: 394
checking geos-config usability... 
./configure: line 1385: geos-config: command not found
no
configure: error: geos-config not usable
ERROR: configuration failed for package ‘rgeos’
* removing ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15/rgeos’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘rgeos’ had non-zero exit status

Пробачте за моє невігластво, але я не знаю, звідки походить цей файл, "geos-config": чи він повинен бути згенерований компіляціями gcc, наведеними вище, чи він повинен бути встановлений раніше, коли бібліотеки libgeos були встановлені?

Я дізнався з іншої машини, що "geos-config" - це виконуваний файл, і його слід встановлювати в / usr / bin.

Чи маєте ви уявлення про те, що не так у моїй процедурі?

Дякую,

-Серджіо.

Відповіді:


14

Встановіть пакет libgeos-devВстановіть libgeos-dev улюбленим менеджером пакунків (або програмним центром) /usr/bin/geos-config.

Як я це знайшов? Я використав запит geos-configдля файлів на веб-сторінці http://packages.ubuntu.com/ . Тут буде вказано необхідний вам пакет ( посилання на запит ). Використовуйте це наступного разу, коли у вас виникнуть подібні проблеми!


2
Ви також можете використовувати хороший інструмент apt-fileдля пошуку файлів у ubuntu repo. Напр. apt-file search geos-configдасть вам точну відповідність libgeos-dev.
ortang

Дякую! Я зробив, як ви рекомендували, і R-пакет "rgeos" також був встановлений без проблем.
JulioSergio

2

Оскільки ОП не називає конкретного дистрибутива, ось рядок, який мені знадобився для встановлення go-config на CENTOS (наприклад, RHEL та Amazon Linux): yum install -y geos-devel

Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.