Побудова ATLAS (а пізніше Octave w / ATLAS)


9

Я намагаюся налаштувати ATLAS (щоб згодом я могла скласти октаву з підтримкою ATLAS).

Якщо я маю рацію, мені все-таки потрібно створити це вручну завдяки специфічним оптимізаціям середовища. Я бачу пакет для ATLAS, але схоже, що він використовує універсальні параметри побудови міжплатформових плат (наприклад, "це буде повільно").

Отже, запуск сценарію налаштування, описаного в документах, здається поганим. Як розробник Java, я ніколи не роблю добре робити помилки в цих процесах збирання. Чи бракує мені залежностей (якщо так, чи є документація щодо того, що мені потрібно)?

allusers@vbubuntu:~/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu$ ../configure -b 64 -D c -DPentiumCPS=3000 --with-netlib-lapack-tarfile=/home/allusers/Downloads/lapack-3.5.0.tgz

make: `xconfig' is up to date.
./xconfig -d s /home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu/../ -d b /home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu  -b 64 -D c -DPentiumCPS=3000 -Si lapackref 1

OS configured as Linux (1)

Assembly configured as GAS_x8664 (2)

Vector ISA Extension configured as  SSE3 (6,448)
ERROR: enum fam=3, chip=2, mach=0
make[3]: *** [atlas_run] Error 44
make[2]: *** [IRunArchInfo_x86] Error 2

Architecture configured as  Corei1 (25)
ERROR: enum fam=3, chip=2, mach=0
make[3]: *** [atlas_run] Error 44
make[2]: *** [IRunArchInfo_x86] Error 2

Clock rate configured as 2350Mhz
ERROR: enum fam=3, chip=2, mach=0
make[3]: *** [atlas_run] Error 44
make[2]: *** [IRunArchInfo_x86] Error 2

Maximum number of threads configured as  4
Parallel make command configured as '$(MAKE) -j 4'
ERROR: enum fam=3, chip=2, mach=0
make[3]: *** [atlas_run] Error 44
make[2]: *** [IRunArchInfo_x86] Error 2
Cannot detect CPU throttling.
rm -f config1.out
make atlas_run atldir=/home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu exe=xprobe_comp redir=config1.out \
                args="-v 0 -o atlconf.txt -O 1 -A 25 -Si nof77 0 -V 448   -b 64 -d b /home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu"
make[1]: Entering directory `/home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu'
cd /home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu ; ./xprobe_comp -v 0 -o atlconf.txt -O 1 -A 25 -Si nof77 0 -V 448   -b 64 -d b /home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu > config1.out
make[2]: gfortran: Command not found
make[2]: *** [IRunF77Comp] Error 127
make[2]: g77: Command not found
make[2]: *** [IRunF77Comp] Error 127
make[2]: f77: Command not found
make[2]: *** [IRunF77Comp] Error 127


Unable to find usable compiler for F77; abortingMake sure compilers are in your path, and specify good compilers to configure
(see INSTALL.txt or 'configure --help' for details)make[1]: *** [atlas_run] Error 8
make[1]: Leaving directory `/home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu'
make: *** [IRun_comp] Error 2
ERROR 512 IN SYSCMND: 'make IRun_comp args="-v 0 -o atlconf.txt -O 1 -A 25 -Si nof77 0 -V 448   -b 64"'
mkdir src bin tune interfaces
mkdir: cannot create directory ‘src’: File exists
mkdir: cannot create directory ‘bin’: File exists
mkdir: cannot create directory ‘tune’: File exists
mkdir: cannot create directory ‘interfaces’: File exists
make: *** [make_subdirs] Error 1
make -f Make.top startup
make[1]: Entering directory `/home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu'
Make.top:1: Make.inc: No such file or directory
Make.top:325: warning: overriding commands for target `/AtlasTest'
Make.top:76: warning: ignoring old commands for target `/AtlasTest'
make[1]: *** No rule to make target `Make.inc'.  Stop.
make[1]: Leaving directory `/home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu'
make: *** [startup] Error 2
mv: cannot move ‘lapack-3.5.0’ to ‘../reference/lapack-3.5.0’: Directory not empty
mv: cannot stat ‘lib/Makefile’: No such file or directory
../configure: 450: ../configure: cannot create lib/Makefile: Directory nonexistent
../configure: 451: ../configure: cannot create lib/Makefile: Directory nonexistent
../configure: 452: ../configure: cannot create lib/Makefile: Directory nonexistent
../configure: 453: ../configure: cannot create lib/Makefile: Directory nonexistent
../configure: 509: ../configure: cannot create lib/Makefile: Directory nonexistent
DONE configure

Відповіді:


12

Найкращий спосіб побудувати бібліотеку ATLAS, налаштовану під ваш конкретний процесор, - це дотримуватися інструкцій /usr/share/doc/libatlas3-base/README.Debian(також доступних для читання в Інтернеті тут ). Інструкції чітко розповідають, як відновити atlasвихідний пакет для Debian / Ubuntu таким чином, щоб ви отримали спеціально створені пакети, які можна встановити замість пакетів, наданих в офіційних сховищах.

Відповідний уривок з цього README.Debianповідомлення:

Створення оптимізованих пакетів Atlas на вашому ARCH

Створення власних оптимізованих пакетів Atlas - це просто. Просто отримайте джерела пакету та його залежність від побудови:

# apt-get source atlas
# apt-get build-dep atlas
# apt-get install devscripts

і введіть наступне з підкаталогу джерела атласу:

# fakeroot debian/rules custom

він повинен створити пакет під назвою:

../libatlas3-base_*.deb

який оптимізований під архітектуру, на якій був побудований Atlas. Потім встановіть пакет за допомогою dpkg -i.


Після останнього кроку 'dpkg -i' як я компілюю / посилаю проти ATLAS 'CBLAS та CLAPACK? У мене немає жодної ATLAS в / usr / local. Які аргументи -I та -L слід передати до g ++? Я спробував 'g ++ main.cpp -I $ ~ / atlas-xxxx / включати -L ~ / atlas-xxxx / build / atlas-base / lib / -lf77blas -lcblas -latlas', але це дає мені '/ usr / bin / ld: не вдається знайти -lf77blas '. Дякую.
лососеві удари

1
@Salmonstrikes Встановіть libatlas-base-devі libatlas-devпакунки, які також були побудовані, і бібліотеки встановлені для вбудовування /usr/lib.
Майк Міллер

1
Дякую! Це працювало Для довідки в майбутньому, щоб отримати код для компіляції, мені потрібно: 1) використовувати Екстерн «C» охоронців як «cblas.h» і «clapack.h» stackoverflow.com/questions/10786237 / ... 2) «г ++ main.cpp -I / usr / включати / атлас -lf77blas -lcblas -llapack_atlas '; чомусь '-lapack' поодинці не працює, і мені знадобилося '-llapack_atlas'
Salmonstrikes

3

Схоже, це були необхідні залежності, зараз працює процес збирання. Ці речі ніколи не бувають легко задокументовані у приємній споживчій формі.

Для Ubuntu (gfortran, g77 та f77 відповідно):

sudo apt-get install gfortran f2c libcnf-dev

Крім того, кожен, хто знайде це запитання, може знайти це пов'язане статкове запитання про використання:

/programming/23876286/building-octave-from-source-did-atlas-get-get-included-properly-in-octaves-confi

Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.