Видалення програмного забезпечення концептуально схоже і в Windows, і в Ubuntu: файли можуть бути видалені, а параметри конфігурації можуть бути видалені. Незалежно від того, чи всі файли чи налаштування конфігурації буде видалено процесом видалення, залежить від програмного забезпечення, яке ви видаляєте, а не ОС.
Програмне забезпечення (і в Windows, і в Ubuntu) може залишати залишки з багатьох причин, починаючи від простої ліньки творця програмного забезпечення, до збереження налаштувань користувача для потенційних перевстановлень, до свідомого залишення файлів, створених програмним забезпеченням (прикладом може бути програмне забезпечення для обробки тексту: користувачі було б дуже шалено, якби всі створені з ним документи були видалені після видалення)
Як правило, залишення файлів та налаштувань конфігурації дещо сильніше спокушається у світі Linux, ніж у світі Windows, але в більшості випадків будь-які залишені файли або ключі реєстру призначені для використання тільки у відповідній програмі. Тому, крім того, що витрачають місце на жорсткому диску, вони не повинні впливати на продуктивність та стабільність системи. Це справедливо і для Windows, і для Ubuntu.
Однак програми, які вносять модифікації системи, такі як драйвери, демони, системні інструменти тощо, але насправді будь-яке програмне забезпечення, яке просило вас отримати кореневий доступ (елевація в Windows) під час встановлення, не має жодних технічних зобов’язань видаляти все після видалення, і може залишити залишки, які можуть погіршити продуктивність системи, стабільність та безпеку. Ще раз це стосується як Windows, так і Ubuntu.
Якщо ви повинні гарантувати, що видалення не матиме негативного впливу на вашу систему, переконайтеся, що ви встановили лише програмне забезпечення, яке не потребує кореневого доступу (елевація в Windows). Якщо ви будете встановлювати програмне забезпечення, яке вимагає кореневого доступу (елевація в Windows), то всі гарантії вимкнені, тому я рекомендую вам дотримуватися видавців програмного забезпечення, яким ви довіряєте, і сподіватися на найкраще.
Зауважте, що, згадуючи Windows, я кажу про Windows Vista і вище, які за замовчуванням працюють на обмежених облікових записах користувачів.