Відповідно до наступного рядка вашого повідомлення, у вас встановлений jayatana
пакет:
Picked up JAVA_TOOL_OPTIONS: -javaagent:/usr/share/java/jayatanaag.jar
Цей пакет відповідає за підтримку меню програм для додатків Swing Java і, здається, є причиною для сегмента за замовчуванням. Видалення це спрацювало для мене:
sudo apt-get remove jayatana
Не забудьте після цього перезапустити сеанс, оскільки в пакеті встановлена JAVA_TOOL_OPTIONS
змінна середовище. Або спробуйте з вікна терміналу:
JAVA_TOOL_OPTIONS= /path/to/your/matlab