Витяг .gz файлів, що містяться в папці

У мене папка, яка містить приблизно 320116 файли .pdb.gz. Хочеться розпакувати їх усіх. Якщо я використовую gunzip * .gz, це дає мені помилку, тобто список аргументів занадто довгий. Папка близько 2 Гб. Будь ласка, дайте мені відповідну пропозицію.

find . -name '*.pdb.gz' -exec gunzip {} +

-exec gunzip {} +надасть gunzipбагато, але не занадто багато імен файлів у своєму командному рядку. Це більш ефективно, ніж -exec gunzip {} \;це запускає новий gunzipпроцес для кожного файлу.

Щоразу, коли ви отримуєте помилки "списку аргументів", ви можете обійти його, викликаючи потрібну команду кілька разів, кожен раз із підмножиною аргументів, які ви хочете використовувати. xargsце інструмент, який допоможе вам зробити це автоматично.

find . -type f -a -name \*.pdb.gz -print0 | xargs -0 gunzip

Я думаю, що це має спрацювати, воно передає шлях / ім’я кожного файлу окремо до gunzip для обробки:

find /my/dir -name "*.pdb.gz" -execdir gunzip "{}" \;

Спробуйте таким чином:

find . -name '*.gz' -exec gunzip {} \;

Якщо у вас багатоядерна машина, ви, ймовірно, побачите, що використання gunzipне збільшить можливості вашої машини. Для цього вам потрібно запустити кілька gunzips паралельно. Щоб відстежувати, що робиться, в якому терміналі вручну є громіздким, але ви можете легко зробити це за допомогою паралелі GNU:

find . -name "*.gz" | parallel -X gunzip {}

Для цього зайве використовувати find, оскільки ви не згадали про підпапки. Що вам потрібно зробити:

for f in *.gz;do gunzip $f;done