Це дуже гарне запитання. Спочатку давайте перевіримо, чи правильна ваша формула. Надана вами інформація відповідає наступній причинно-наслідковій моделі:
І як ви вже сказали, ми можемо отримати оцінку для P(Y|do(X))користуючись правилами числення. У R ми можемо легко зробити це з пакетом causaleffect
. Спочатку завантажуємось igraph
для створення об'єкта за допомогою причинно-наслідкової діаграми, яку ви пропонуєте:
library(igraph)
g <- graph.formula(X-+Y, Y-+X, X-+Z-+Y, W-+X, W-+Z, W-+Y, simplify = FALSE)
g <- set.edge.attribute(graph = g, name = "description", index = 1:2, value = "U")
Де перші два терміни X-+Y, Y-+X
представляють непомічені плутаниниX і Y а решта термінів представляють згадані вами спрямовані краї.
Тоді ми просимо нашу оцінку:
library(causaleffect)
cat(causal.effect("Y", "X", G = g, primes = TRUE, simp = T, expr = TRUE))
∑W,Z(∑X′P(Y|W,X′,Z)P(X′|W))P(Z|W,X)P(W)
Що дійсно збігається з вашою формулою --- випадок фронтону із спостережуваним конфеденсом.
Тепер перейдемо до оцінки. Якщо ви припускаєте лінійність (і нормальність), все значно спрощується. В основному те, що ви хочете зробити, - це оцінити коефіцієнти шляхуX→Z→Y.
Давайте змоделюємо деякі дані:
set.seed(1)
n <- 1e3
u <- rnorm(n) # y -> x unobserved confounder
w <- rnorm(n)
x <- w + u + rnorm(n)
z <- 3*x + 5*w + rnorm(n)
y <- 7*z + 11*w + 13*u + rnorm(n)
Зауважте в нашому моделюванні справжній причинний ефект зміни X на Yє 21. Ви можете оцінити це, застосувавши дві регресії. Спочатку Y∼Z+W+X щоб отримати ефект від Z на Y і потім Z∼X+W щоб отримати ефект від X на Z. Ваша оцінка буде добутком обох коефіцієнтів:
yz_model <- lm(y ~ z + w + x)
zx_model <- lm(z ~ x + w)
yz <- coef(yz_model)[2]
zx <- coef(zx_model)[2]
effect <- zx*yz
effect
x
21.37626
А для висновку ви можете обчислити (асимптотичну) стандартну помилку продукту:
se_yz <- coef(summary(yz_model))[2, 2]
se_zx <- coef(summary(zx_model))[2, 2]
se <- sqrt(yz^2*se_zx^2 + zx^2*se_yz^2)
Які ви можете використовувати для тестів або довірчих інтервалів:
c(effect - 1.96*se, effect + 1.96*se) # 95% CI
x x
19.66441 23.08811
Ви також можете виконати (не / напів) параметричне оцінювання, я спробую оновити цю відповідь, включаючи інші процедури пізніше.