Як порівняти два набори даних із графіком QQ за допомогою ggplot2?


11

Як і статистика, так і R-початківець, мені було дуже важко намагатися генерувати qqplots із співвідношенням сторін 1: 1. ggplot2, здається, пропонує набагато більший контроль над побудовою графіку, ніж пакети графіку R за замовчуванням, але я не можу зрозуміти, як зробити qqplot в ggplot2 для порівняння двох наборів даних.

Отже, моє запитання, що таке еквівалент ggplot2 чимось на кшталт:

qqplot(datset1,dataset2)

Документи ggplot2 можуть бути корисні: docs.ggplot2.org/current/stat_qq.html
Чарлі

Відповіді:


12

Найпростіше це просто подивитися, як це qqplotпрацює. Отже, у тип R:

R> qqplot
function (x, y, plot.it = TRUE, xlab = deparse(substitute(x)), 
    ylab = deparse(substitute(y)), ...) 
{
    sx <- sort(x)
    sy <- sort(y)
    lenx <- length(sx)
    leny <- length(sy)
    if (leny < lenx) 
        sx <- approx(1L:lenx, sx, n = leny)$y
    if (leny > lenx) 
        sy <- approx(1L:leny, sy, n = lenx)$y
    if (plot.it) 
        plot(sx, sy, xlab = xlab, ylab = ylab, ...)
    invisible(list(x = sx, y = sy))
}
<environment: namespace:stats>

Таким чином , щоб сформувати ділянку , ми просто повинні отримати sxі sy, тобто

x <- rnorm(10);y <- rnorm(20)

sx <- sort(x); sy <- sort(y)
lenx <- length(sx)
leny <- length(sy)
if (leny < lenx)sx <- approx(1L:lenx, sx, n = leny)$y
if (leny > lenx)sy <- approx(1L:leny, sy, n = lenx)$y

require(ggplot2)
g = ggplot() + geom_point(aes(x=sx, y=sy))
g

qqplot за допомогою ggplot2


2
ggplot2Чи є спосіб stat_qq(), як це використати? Здається, він створений для порівняння одного вектора з теоретичним розподілом, я не міг зрозуміти, як використовувати його для порівняння двох різних векторів.
Кен Вільямс

7
Ви можете насправді qqplot()зробити всі sort/ length/ approxрозрахунки для вас: d <- as.data.frame(qqplot(x, y, plot.it=FALSE)); ggplot(d) + geom_point(aes(x=x, y=y))
Кен Вільямс

9

Я використовую це, коли також хочу нормальну лінію.

ggplot(data, aes(sample = data$column1)) + stat_qq(color="firebrick2", alpha=1) + geom_abline(intercept = mean(data$column1), slope = sd(data$column1))


0

Якщо ваша первісна потреба полягає лише в тому, щоб контролювати співвідношення сторін, ось один із способів:

x <- rnorm(1000)
y <- rnorm(1500, 2)

myqq <- function(x, y, ...) {
  rg <- range(x, y, na.rm=T)
  qqplot(x, y, xlim=rg, ylim=rg, ...)
}

myqq(x, y)

сюжет myqq

Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.