Оцінка мінливості в часі


10

У мене є набір даних, який містить ~ 7500 аналізів крові від ~ 2500 людей. Я намагаюся з’ясувати, чи збільшується або зменшується мінливість в аналізі крові з часом між двома тестами. Наприклад - я беру кров для базової проби, а потім негайно беру другий зразок. Через півроку малюю ще один зразок. Можна очікувати, що різниця між базовою лінією та негайними повторними тестами буде меншою, ніж різниця між базовою лінією та шестимісячним тестом.

Кожна точка на графіку нижче відображає різницю між двома тестами. X - кількість днів між двома тестами; Y - величина різниці між двома тестами. Як бачите, тести не розподілені рівномірно по X - дослідження не було розроблене для вирішення цього питання. Оскільки точки настільки сильно розміщені в середньому, я включив 95% (сині) та 99% (червоні) квантильні лінії на основі вікон на 28 днів. Вони, очевидно, тягнуться навколо більш екстремальних моментів, але ви розумієте.

alt text http://a.imageshack.us/img175/6595/diffsbydays.png

Мені здається, що мінливість досить стабільна. Якщо що-небудь, то це вище, коли тест повторюється протягом короткого періоду - це жахливо протипоказано. Як я можу вирішити це систематично, враховуючи різну n у кожний момент часу (та деякі періоди, у яких взагалі відсутні тести)? Ваші ідеї дуже вдячні.

Для довідки, це розподіл кількості днів між тестом та повторним тестуванням:

alt text http://a.imageshack.us/img697/6572/testsateachtimepoint.png


+1 за цікавий реальний випадок! чи можете ви допомогти нам зрозуміти, що таке аналіз крові? (як ви це обчислите)
Робін Жирард

Була стаття про ЛФП (тести функціонування печінки) та про те, як вона, здавалося, змінюється в циклічній основі (за місяцями). Я думаю, це було в «Аналах внутрішньої медицини».
Ming K

Звичайно - коротко, це тест на латентну туберкульозну інфекцію. Кров відбирається від пацієнта в три пробірки: ту, у якій немає антигенів, та, яка вибрала протитуберкульозні антигени, і ту, яка має мітоген. Потім ми порівнюємо кількість імунологічної відповіді в пробірці без антигенів з тією, що має туберкульоз - якщо вони мають сильний посилення реакції в туберкульозній трубці, вони можуть мати прихований туберкульоз. (Мітогенна трубка служить перевіркою для того, щоб переконатися, що людина здатна взагалі виробляти імунологічну відповідь - більшість людей мають дуже сильні реакції на неї)
Метт Паркер

Відповіді:


3

З вашого опису я не бачу жодної причини, щоб відрізнити "базовий тест" від негайно складеного "другого зразка". Вони просто 2 вимірювання базової лінії, і дисперсія (на базовій лінії) може бути обчислена на цій основі. Було б краще побудувати середнє значення двох вимірювань базової лінії порівняно з третьою вибіркою "шість місяців".

Проблема полягає у вибірці на 6 місяців. Оскільки в цей момент береться лише одна проба, то в цій точці немає можливості оцінити "мінливість", а точніше відокремити варіацію вибірки від поздовжньої (реальної) зміни читання ТБ.

Якщо ми вважаємо це проблемою поздовжнього аналізу даних, ми, мабуть, оберемо випадковий перехоплення (базовий ТБ) та випадковий нахил (для 6-місячного ТБ). Змінність вибірки буде оцінена з двох базових вимірювань та нахилу від третього 6-місячного вимірювання. Ми не можемо оцінити цю мінливість за 6 місяців без сильних припущень щодо розподілу щодо зміни за ці півроку, наприклад, якщо припустити, що жодних змін не буде.

Використовуючи наш веб-сайт, ви визнаєте, що прочитали та зрозуміли наші Політику щодо файлів cookie та Політику конфіденційності.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.