Точний тест Фішера в таблицях на випадок, більший за 2х2

29

Мене вчили застосовувати точний тест Фішера лише у таблицях на випадок надзвичайних ситуацій, які були 2х2.

Запитання:

Чи вважав сам Фішер коли-небудь цей тест використовувати в таблицях розміром більше 2х2 (мені відомо, що казка про нього розробляє тест, намагаючись вгадати, чи могла бабуся сказати, чи в чай додають молоко чи додають чай у молоко )
Статистичні дані дозволяють використовувати точний тест Фішера до будь-якої таблиці надзвичайних ситуацій. Чи дійсно це?
Чи бажано використовувати FET, коли очікувана кількість клітин у таблиці надзвичайних ситуацій становить <5?

— pmgjones
джерело

1

Ви можете подумати, наскільки насправді точний тест Фішера: stat.columbia.edu/~gelman/research/published/isr.pdf (Розділ 3.3)

— о.

Ви можете обчислити точний тест Фішера в Р. Їх метод фактично використовує мережевий алгоритм, щоб зробити його досить швидким: stat.ethz.ch/R-manual/R-patched/library/stats/html/… Див. Документ [Мехта та Patel 1986]

— Симона,

20

Єдина проблема із застосуванням точного тесту Фішера до таблиць, розмірів яких перевищує 2х2, полягає в тому, що обчислення зробити набагато складніше. Версія 2x2 є єдиною, яка навіть вручну можлива, і тому я сумніваюся, що Фішер коли-небудь уявляв тест у більших таблицях, оскільки обчислення були б поза тим, що він би передбачив.

Тим не менш, тест може бути застосований до будь-якої таблиці mxn, а деяке програмне забезпечення, включаючи Stata та SPSS, надає можливість. Незважаючи на це, обчислення часто наближаються за допомогою підходу Монте-Карло.

Так, якщо очікувана кількість клітин невелика, краще скористатися точним тестом, оскільки тест у квадратику більше не є гарним наближенням у таких випадках.

— Роб Хайндман
джерело

Чи можете ви вказати мені, де я можу знайти документацію, як зробити тест Фішера за допомогою SPSS? Дякую

— biostat_newbie

Подивіться під переклади

— Роб Хайндман

Зважаючи на те, що програмне забезпечення може зробити обчислення так легко в даний час, чи є обставина, коли теоретично чи практично, тест з квадратом Chi фактично кращий перед точним тестом Фішера?

— pmgjones

У багатьох випадках "точний" тест зовсім не точний, і багато "приблизних" методів мають охоплення ближче до номінального рівня значущості. Див., Наприклад, Алан Агрешті та Брент А. Кулл (1998) "Приблизна краща за" Точну "для інтервальної оцінки біноміальних пропорцій" Американський статистик , 52 (2): 119-126.

— Маартен Буїс

2

Який приблизно максимальний розмір таблиці надзвичайних ситуацій, який можна проаналізувати за допомогою точного методу Фішера у можливі часові рамки (скажімо, тиждень на стандартному ноутбуці)?

— бенкету

6

На цій сторінці в MathWorld пояснюється, як працюють розрахунки. Він вказує, що тест можна визначити різними способами:

Для обчислення P-значення тесту таблиці повинні бути впорядковані за деяким критерієм, який вимірює залежність, а ті таблиці, які представляють рівне або більше відхилення від незалежності, ніж спостережувана таблиця, - ті, імовірності яких додаються разом. Існують різноманітні критерії, які можна використовувати для вимірювання залежності.

Мені не вдалося знайти інших статей чи текстів, які пояснюють, як це робиться з таблицями розміром більше 2х2.

Цей калькулятор обчислює точний тест Фішера для таблиць з 2 стовпцями та до 5 рядків. Критерій, який він використовує, - це гіпергеометрична ймовірність кожної таблиці. Загальне значення P - це сума гіпергеометричної ймовірності всіх таблиць з однаковими граничними підсумками, ймовірності яких менші або рівні вірогідності, обчисленої з фактичних даних.

— Харві Мотульський
джерело

3

Якщо ви шукаєте інші способи обчислити точний тест Фішера з більшими таблицями на випадок надзвичайних ситуацій, ось онлайн-калькулятор точного тесту Фішера для 2x3 таблиць на випадок надзвичайних ситуацій . Також ось одна для таблиць на випадок 3х3 та одна для 2х4 таблиць на випадок надзвичайних ситуацій .

Так, якщо очікувана кількість клітин невелика, краще скористатися точним тестом Фішера замість тесту чи-квадрата, якщо це можливо.

— DW
джерело

2

Для того, щоб отримати точний тест Фішера в SPSS, скористайтеся опцією Статистика = Точний в перехресних вкладках. Методи обчислення Точного Тедта для більших таблиць існують щонайменше з 1960-х років. Швидкість роботи сучасних мікропроцесорів робить час обчислень невпливним у ці дні. Дійсно, запустити точний тест так просто, що важливо не використовувати його занадто широко.

— StatisticsDoc Consulting
джерело