Існує кілька способів обчислення довірчих інтервалів для середнього значення лонормального розподілу. Я збираюся представити два методи: вірогідність завантаження та профілю. Я також презентую дискусію на тему "Джеффріс".
Завантажувач
Для MLE
В цьому випадку ОМП (μ,σ) для зразка (x1,...,xn) є
μ^=1n∑j=1nlog(xj);σ^2=1n∑j=1n(log(xj)−μ^)2.
Потім ОМП середнє одно δ = ехр ( μ + σ 2 / 2 ) . За передискретизации можна отримати зразок самозавантаження з б і, використовуючи це, ми можемо обчислити кілька самозавантаження довірчих інтервалів. Наступні коди показують, як їх отримати.δ^=exp(μ^+σ^2/2)δ^R
rm(list=ls())
library(boot)
set.seed(1)
# Simulated data
data0 = exp(rnorm(100))
# Statistic (MLE)
mle = function(dat){
m = mean(log(dat))
s = mean((log(dat)-m)^2)
return(exp(m+s/2))
}
# Bootstrap
boots.out = boot(data=data0, statistic=function(d, ind){mle(d[ind])}, R = 10000)
plot(density(boots.out$t))
# 4 types of Bootstrap confidence intervals
boot.ci(boots.out, conf = 0.95, type = "all")
Для вибірки середнє значення
Тепер розглянемо оцінювач δ~=x¯ замість MLE. Можливо також розглянути інші типи оцінювачів.
rm(list=ls())
library(boot)
set.seed(1)
# Simulated data
data0 = exp(rnorm(100))
# Statistic (MLE)
samp.mean = function(dat) return(mean(dat))
# Bootstrap
boots.out = boot(data=data0, statistic=function(d, ind){samp.mean(d[ind])}, R = 10000)
plot(density(boots.out$t))
# 4 types of Bootstrap confidence intervals
boot.ci(boots.out, conf = 0.95, type = "all")
Імовірність профілю
Для визначення ймовірності та функцій вірогідності профілю див . Використовуючи властивість інваріантності ймовірності ми можемо reparameterise наступним чином (μ,σ)→(δ,σ) , де δ=exp(μ+σ2/2) , а потім розрахувати чисельно профіль ймовірності δ .
Rp(δ)=supσL(δ,σ)supδ,σL(δ,σ).
Ця функція приймає значення в (0,1] ; інтервал рівня 0.147 має приблизну довіру 95% . Ми будемо використовувати цю властивість для побудови довірчого інтервалу для δ . Наступні R
коди показують, як отримати цей інтервал.
set.seed(1)
# Simulated data
data0 = exp(rnorm(100))
# Log likelihood
ll = function(mu,sigma) return( sum(log(dlnorm(data0,mu,sigma))))
# Profile likelihood
Rp = function(delta){
temp = function(sigma) return( sum(log(dlnorm(data0,log(delta)-0.5*sigma^2,sigma)) ))
max=exp(optimize(temp,c(0.25,1.5),maximum=TRUE)$objective -ll(mean(log(data0)),sqrt(mean((log(data0)-mean(log(data0)))^2))))
return(max)
}
vec = seq(1.2,2.5,0.001)
rvec = lapply(vec,Rp)
plot(vec,rvec,type="l")
# Profile confidence intervals
tr = function(delta) return(Rp(delta)-0.147)
c(uniroot(tr,c(1.2,1.6))$root,uniroot(tr,c(2,2.3))$root)
⋆ Байєсів
У цьому розділі альтернативний алгоритм, заснований на вибірці Метрополіс-Гастінгса та використанні попереднього Джеффріса, для обчислення інтервалу достовірності для δ .
(μ,σ)
π(μ,σ)∝σ−2,
n≥2R
library(mcmc)
set.seed(1)
# Simulated data
data0 = exp(rnorm(100))
# Log posterior
lp = function(par){
if(par[2]>0) return( sum(log(dlnorm(data0,par[1],par[2]))) - 2*log(par[2]))
else return(-Inf)
}
# Metropolis-Hastings
NMH = 260000
out = metrop(lp, scale = 0.175, initial = c(0.1,0.8), nbatch = NMH)
#Acceptance rate
out$acc
deltap = exp( out$batch[,1][seq(10000,NMH,25)] + 0.5*(out$batch[,2][seq(10000,NMH,25)])^2 )
plot(density(deltap))
# 95% credibility interval
c(quantile(deltap,0.025),quantile(deltap,0.975))
Зауважте, що вони дуже схожі.