Непараметричний байєсівський аналіз в R

Я шукаю гарний підручник з кластеризації даних при Rвикористанні ієрархічного процесу діріхле (HDP) (один з останніх і популярних непараметричних методів Байєса).

Існує DPpackage(ІМХО, найбільш повний з усіх доступних) Rдля непараметричного байєсівського аналізу. Але я не в змозі зрозуміти приклади, подані в R Newsпосібнику з посібника або в його посібнику досить добре, щоб кодувати HDP.

Будь-яка допомога чи покажчик цінуються.

C ++ реалізація HDP для моделювання тема доступна тут (будь ласка , подивіться в нижній частині для коду C ++)

Ось кілька онлайн-ресурсів, які мені здалися цікавими, не заглиблюючись у деталі (і я не фахівець з цієї теми):

• Ієрархічні процеси Діріхле , від Teh et al. (2005)
• Діріхле Процеси Ніжний підручник , Ель-Аріні (2008)
• Байесівська непараметрія , Розаско (2010)
• Непараметричні баєсові методи , Гахрамані (2005)

Остаточне посилання, здається, є

Н. Хорт, К. Холмс, П. Мюллер та С. Уокер, редактори. Байєсівська непараметрика . Число 28 у Кембриджській серії зі статистичної та ймовірнісної математики. Cambridge University Press, 2010.

Щодо R, мабуть, є деякі інші пакети, які варто вивчити, чи DPpackage не відповідає вашим потребам, наприклад, dpmixsim , BHC або mbsc, знайдені на Rseek.org .

Ці два посилання надають кілька прикладів коду R (і C) реалізації нормальної суміші DP:

• http://ice.uchicago.edu/2008_presentations/Rossi/density_estimation_with_DP_priors.ppt
• http://www.duke.edu/~neelo003/r/DP02.r

Знайшов ще одне посилання. Розділ 15 містить код winbugs DP:

• http://www.ics.uci.edu/~wjohnson/BIDA/BIDABook.html