Частка поясненої дисперсії в моделі зі змішаними ефектами

Я не знаю, чи це просили раніше, але я нічого не знайшов про це. Моє запитання полягає в тому, якщо хтось може надати хороший посилання, щоб дізнатися, як отримати пропорцію дисперсії, пояснену кожним із фіксованих та випадкових факторів у моделі зі змішаними ефектами.

Я можу надати кілька посилань:

Сю, Р. (2003). Вимірювання пояснених варіацій лінійних моделей зі змішаними ефектами. Статистика в медицині , 22 , 3527-3541.DOI: 10.1002 / sim.1572

Edwards, LJ, Muller, KE, Wolfinger, RD, Qaqish, BF, & Schabenberger, O. (2008). Статистика для фіксованих ефектів у лінійній змішаній моделі. Статистика в медицині , 27 , 6137-6157.$R^2$DOI: 10.1002 / sim.3429

Hössjer, O. (2008). Про коефіцієнт визначення для моделей змішаної регресії. Журнал статистичного планування та висновку , 138 , 3022-3038. DOI: 10.1016 / j.jspi.2007.11.010

$R^2$

Щасливого читання!

MuMInR$^2$$^1$ ( про який згадувалося в попередньому відповіді ).

#load packages
library(lme4)
library(MuMIn)

#Fit Model
m <- lmer(mpg ~ gear + disp + (1|cyl), data = mtcars)

#Determine R2:
r.squaredGLMM(m) 

       R2m       R2c 
 0.5476160 0.7150239  

Вихід для функції r.squaredGLMMзабезпечує:

• R2m : граничне значення R квадрата, пов'язане з фіксованими ефектами

• R2c значення R2, пов'язане з фіксованими ефектами плюс випадкові ефекти.

Примітка: коментар до пов’язаної публікації блогу говорить про те, що альтернативний підхід на Нагагава та Шильцет надихнув Джон Лефчек (використовуючи sem.model.fitsфункцію вpiecewiseSEM пакеті), дав однакові результати. [Отже, у вас є варіанти: p].

• Я не перевіряв цю останню функцію, але я протестував r.squaredGLMM() функцію в MuMInпакеті, і тому я можу засвідчити, що вона функціонує і сьогодні (2018).

• $^2$

^{1: Nakagawa, S., Schielzeth, H. 2013. Загальний і простий метод отримання R2 з узагальнених лінійних моделей змішаних ефектів. Методи в екології та еволюції 4 (2): 133-142.}

^{2: Джонсон, PCD 2014 Розширення Nagagawa & Schielzeth R2GLMM до випадкових моделей схилів. Методи екології та еволюції 5: 44–946.}